Как преобразовать файл csv в паркет

Я новичок в BigData. Мне нужно преобразовать файл csv/txt в формат Паркета. Я много искал, но не мог найти прямой способ сделать это. Есть ли способ достичь этого?

Ответы

Ответ 1

Вот пример кода, который делает это в обоих направлениях.

Ответ 2

Вы можете использовать сверло Apache, как описано в разделе Преобразование CSV файла в Apache Parquet With Drill.

Вкратце:

Начать сверление Apache:

$ cd /opt/drill/bin
$ sqlline -u jdbc:drill:zk=local

Создайте файл Parquet:

-- Set default table format to parquet
ALTER SESSION SET 'store.format'='parquet';

-- Create a parquet table containing all data from the CSV table
CREATE TABLE dfs.tmp.'/stats/airport_data/' AS
SELECT
CAST(SUBSTR(columns[0],1,4) AS INT)  'YEAR',
CAST(SUBSTR(columns[0],5,2) AS INT) 'MONTH',
columns[1] as 'AIRLINE',
columns[2] as 'IATA_CODE',
columns[3] as 'AIRLINE_2',
columns[4] as 'IATA_CODE_2',
columns[5] as 'GEO_SUMMARY',
columns[6] as 'GEO_REGION',
columns[7] as 'ACTIVITY_CODE',
columns[8] as 'PRICE_CODE',
columns[9] as 'TERMINAL',
columns[10] as 'BOARDING_AREA',
CAST(columns[11] AS DOUBLE) as 'PASSENGER_COUNT'
FROM dfs.'/opendata/Passenger/SFO_Passenger_Data/*.csv';

Попробуйте выбрать данные из нового файла Parquet:

-- Select data from parquet table
SELECT *
FROM dfs.tmp.'/stats/airport_data/*'

Вы можете изменить местоположение dfs.tmp, перейдя по http://localhost:8047/storage/dfs (source: CSV и Parquet).

Ответ 3

Я уже разместил ответ о том, как это сделать с помощью Apache Drill. Однако, если вы знакомы с Python, теперь вы можете сделать это, используя Pandas и PyArrow !

Установить зависимости

Использование pip:

pip install pandas pyarrow

или используя conda:

conda install pandas pyarrow -c conda-forge

Конвертировать CSV в паркет кусками

# csv_to_parquet.py

import pandas as pd
import pyarrow as pa
import pyarrow.parquet as pq

csv_file = '/path/to/my.tsv'
parquet_file = '/path/to/my.parquet'
chunksize = 100_000

csv_stream = pd.read_csv(csv_file, sep='\t', chunksize=chunksize, low_memory=False)

for i, chunk in enumerate(csv_stream):
    print("Chunk", i)
    if i == 0:
        # Guess the schema of the CSV file from the first chunk
        parquet_schema = pa.Table.from_pandas(df=chunk).schema
        # Open a Parquet file for writing
        parquet_writer = pq.ParquetWriter(parquet_file, parquet_schema, compression='snappy')
    # Write CSV chunk to the parquet file
    table = pa.Table.from_pandas(chunk, schema=parquet_schema)
    parquet_writer.write_table(table)

parquet_writer.close()

Я не сравнивал этот код с версией Apache Drill, но, по моему опыту, он достаточно быстрый, преобразуя десятки тысяч строк в секунду (это, конечно, зависит от файла CSV!).

Ответ 4

Следующий пример является примером использования spark2.0. Чтение намного быстрее, чем опция inferSchema. Spark 2.0 конвертирует в паркетный файл гораздо эффективнее, чем spark1.6.

import org.apache.spark.sql.types._
var df = StructType(Array(StructField("timestamp", StringType, true),StructField("site", StringType, true),StructField("requests", LongType, true) ))
df = spark.read
          .schema(df)
          .option("header", "true")
          .option("delimiter", "\t")
          .csv("/user/hduser/wikipedia/pageviews-by-second-tsv")
df.write.parquet("/user/hduser/wikipedia/pageviews-by-second-parquet")

Ответ 5

1) Вы можете создать таблицу внешнего улья

create  external table emp(name string,job_title string,department string,salary_per_year int)
row format delimited
fields terminated by ','
location '.. hdfs location of csv file '

2) Еще одна таблица улей, в которой будет храниться файл паркета

create  external table emp_par(name string,job_title string,department string,salary_per_year int)
row format delimited
stored as PARQUET
location 'hdfs location were you want the save parquet file'

Вставьте таблицу в одну таблицу в таблицу:

insert overwrite table emp_par select * from emp 

Ответ 6

Читайте csv файлы как Dataframe в Apache Spark с пакетом spark-csv. после загрузки данных в Dataframe сохранить файл данных в паркет файл.

val df = sqlContext.read
      .format("com.databricks.spark.csv")
      .option("header", "true")
      .option("inferSchema", "true")
      .option("mode", "DROPMALFORMED")
      .load("/home/myuser/data/log/*.csv")
df.saveAsParquetFile("/home/myuser/data.parquet")

Ответ 7

from pyspark import SparkContext
from pyspark.sql import SQLContext
from pyspark.sql.types import *
import sys

sc = SparkContext(appName="CSV2Parquet")
sqlContext = SQLContext(sc)

schema = StructType([
    StructField("col1", StringType(), True),
    StructField("col2", StringType(), True),
    StructField("col3", StringType(), True),
    StructField("col4", StringType(), True),
    StructField("col5", StringType(), True)])
rdd = sc.textFile('/input.csv').map(lambda line: line.split(","))
df = sqlContext.createDataFrame(rdd, schema)
df.write.parquet('/output.parquet')