Pandas получить строки, которые НЕ находятся в другом фрейме данных
У меня есть два кадра данных pandas, которые содержат несколько строк.
Предположим, что dataframe2 является подмножеством dataframe1.
Как я могу получить строки dataframe1, которые не находятся в dataframe2?
df1 = pandas.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3, 4, 5], 'col2' : [10, 11, 12, 13, 14]})
df2 = pandas.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3], 'col2' : [10, 11, 12]})
Ответы
Ответ 1
Один из методов заключается в том, чтобы сохранить результат внутренней формы слияния как dfs, тогда мы можем просто выбрать строки, когда одни значения столбцов не входят в это общее:
In [119]:
common = df1.merge(df2,on=['col1','col2'])
print(common)
df1[(~df1.col1.isin(common.col1))&(~df1.col2.isin(common.col2))]
col1 col2
0 1 10
1 2 11
2 3 12
Out[119]:
col1 col2
3 4 13
4 5 14
ИЗМЕНИТЬ
Другой метод, который вы нашли, - это использовать isin, который будет создавать строки NaN, которые вы можете удалить:
In [138]:
df1[~df1.isin(df2)].dropna()
Out[138]:
col1 col2
3 4 13
4 5 14
Однако, если df2 не запускает строки таким же образом, это не будет работать:
df2 = pd.DataFrame(data = {'col1' : [2, 3,4], 'col2' : [11, 12,13]})
будет производить весь df:
In [140]:
df1[~df1.isin(df2)].dropna()
Out[140]:
col1 col2
0 1 10
1 2 11
2 3 12
3 4 13
4 5 14
Ответ 2
Текущее выбранное решение дает неверные результаты. Чтобы правильно решить эту проблему, мы можем выполнить левое соединение от df1 до df2, df2, что сначала получим только уникальные строки для df2.
Во-первых, нам нужно изменить исходный DataFrame, чтобы добавить строку с данными [3, 10].
df1 = pd.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3, 4, 5, 3],
'col2' : [10, 11, 12, 13, 14, 10]})
df2 = pd.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3],
'col2' : [10, 11, 12]})
df1
col1 col2
0 1 10
1 2 11
2 3 12
3 4 13
4 5 14
5 3 10
df2
col1 col2
0 1 10
1 2 11
2 3 12
Выполните левое соединение, исключив дубликаты в df2 чтобы каждая строка df1 ровно с 1 строкой df2. Используйте indicator параметра, чтобы получить дополнительный столбец, в котором указано, из какой таблицы была строка.
df_all = df1.merge(df2.drop_duplicates(), on=['col1','col2'],
how='left', indicator=True)
df_all
col1 col2 _merge
0 1 10 both
1 2 11 both
2 3 12 both
3 4 13 left_only
4 5 14 left_only
5 3 10 left_only
Создайте логическое условие:
df_all['_merge'] == 'left_only'
0 False
1 False
2 False
3 True
4 True
5 True
Name: _merge, dtype: bool
Почему другие решения не верны
Несколько решений допускают одну и ту же ошибку - они только проверяют, что каждое значение независимо в каждом столбце, а не вместе в одной строке. Добавление последней строки, которая является уникальной, но имеет значения из обоих столбцов из df2 выявляет ошибку:
common = df1.merge(df2,on=['col1','col2'])
(~df1.col1.isin(common.col1))&(~df1.col2.isin(common.col2))
0 False
1 False
2 False
3 True
4 True
5 False
dtype: bool
Это решение дает тот же неправильный результат:
df1.isin(df2.to_dict('l')).all(1)
Ответ 3
Предполагая, что индексы согласованы в кадрах данных (не принимая во внимание фактические значения col):
df1[~df1.index.isin(df2.index)]
Ответ 4
Как уже указывалось, isin требует, чтобы столбцы и индексы были одинаковыми для соответствия. Если соответствие должно быть только для содержимого строки, один из способов получить маску для фильтрации имеющихся строк - преобразовать строки в (мульти) индекс:
In [77]: df1 = pandas.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3, 4, 5, 3], 'col2' : [10, 11, 12, 13, 14, 10]})
In [78]: df2 = pandas.DataFrame(data = {'col1' : [1, 3, 4], 'col2' : [10, 12, 13]})
In [79]: df1.loc[~df1.set_index(list(df1.columns)).index.isin(df2.set_index(list(df2.columns)).index)]
Out[79]:
col1 col2
1 2 11
4 5 14
5 3 10
Если индекс должен быть принят во внимание, set_index имеет ключевое слово аргумент, добавляющий столбцы к существующему индексу. Если столбцы не совпадают, список (df.columns) можно заменить спецификациями столбцов для выравнивания данных.
pandas.MultiIndex.from_tuples(df<N>.to_records(index = False).tolist())
в качестве альтернативы может быть использован для создания индексов, хотя я сомневаюсь, что это более эффективно.
Ответ 5
Предположим, что у вас есть два фрейма данных: df_1 и df_2, имеющие несколько полей (column_names), и вы хотите найти только те записи в df_1, которые не находятся в df_2, на основе некоторых полей (например, fields_x, fields_y), следуют следующему шаги.
Step1.Добавьте столбец key1 и key2 в df_1 и df_2 соответственно.
Step2.Merge dataframes, как показано ниже. field_x и field_y - наши искомые столбцы.
Шаг 3.Выберите только те строки из df_1, где key1 не равен ключу2.
Step4.Нажмите ключ1 и клавишу2.
Этот метод решит вашу проблему и быстро работает даже с большими наборами данных. Я попробовал это для файлов данных с более чем 1 000 000 строк.
df_1['key1'] = 1
df_2['key2'] = 1
df_1 = pd.merge(df_1, df_2, on=['field_x', 'field_y'], how = 'left')
df_1 = df_1[~(df_1.key2 == df_1.key1)]
df_1 = df_1.drop(['key1','key2'], axis=1)
Ответ 6
вы можете сделать это, используя isin (dict) метод:
In [74]: df1[~df1.isin(df2.to_dict('l')).all(1)]
Out[74]:
col1 col2
3 4 13
4 5 14
Пояснение:
In [75]: df2.to_dict('l')
Out[75]: {'col1': [1, 2, 3], 'col2': [10, 11, 12]}
In [76]: df1.isin(df2.to_dict('l'))
Out[76]:
col1 col2
0 True True
1 True True
2 True True
3 False False
4 False False
In [77]: df1.isin(df2.to_dict('l')).all(1)
Out[77]:
0 True
1 True
2 True
3 False
4 False
dtype: bool
Ответ 7
немного поздно, но, возможно, стоит проверить параметр "индикатор" pd.merge.
См. другой вопрос для примера:
Сравнить PandaS DataFrames и вернуть строки, отсутствующие в первом
Ответ 8
Вы также можете использовать df1, df2:
x = pd.concat([df1, df2])
а затем удалите все дубликаты:
y = x.drop_duplicates(keep=False, inplace=False)
Ответ 9
Как насчет этого:
df1 = pandas.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3, 4, 5],
'col2' : [10, 11, 12, 13, 14]})
df2 = pandas.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3],
'col2' : [10, 11, 12]})
records_df2 = set([tuple(row) for row in df2.values])
in_df2_mask = np.array([tuple(row) in records_df2 for row in df1.values])
result = df1[~in_df2_mask]
Ответ 10
Вот еще один способ решения этой проблемы:
df1[~df1.index.isin(df1.merge(df2, how='inner', on=['col1', 'col2']).index)]
Или же:
df1.loc[df1.index.difference(df1.merge(df2, how='inner', on=['col1', 'col2']).index)]
Ответ 11
Мой способ сделать это включает в себя добавление нового столбца, который является уникальным для одного фрейма данных, и используя это, чтобы выбрать, сохранять ли запись
df2[col3] = 1
df1 = pd.merge(df_1, df_2, on=['field_x', 'field_y'], how = 'outer')
df1['Empt'].fillna(0, inplace=True)
Это делает так, чтобы каждая запись в df1 имела код - 0, если она уникальна для df1, 1, если она находится в обоих файлах данных. Затем вы используете это для ограничения того, что хотите
answer = nonuni[nonuni['Empt'] == 0]
