Ломаная петля, когда "предупреждения()" появляются в R

У меня проблема: Я запускаю цикл для обработки нескольких файлов. Мои матрицы огромны, и поэтому у меня часто заканчивается память, если я не осторожен.

Есть ли способ выйти из цикла, если будут созданы какие-либо предупреждения? Он просто продолжает работать в цикле и сообщает, что он потерпел неудачу намного позже... раздражает. Любые идеи о мудрых stackoverflow-ers?!

Ответы

Ответ 1

Вы можете включить предупреждения в:

options(warn=2)

В отличие от предупреждений, ошибки прерывают цикл. Хорошо, R также сообщит вам, что эти конкретные ошибки были преобразованы из предупреждений.

j <- function() {
    for (i in 1:3) {
        cat(i, "\n")
        as.numeric(c("1", "NA"))
}}

# warn = 0 (default) -- warnings as warnings!
j()
# 1 
# 2 
# 3 
# Warning messages:
# 1: NAs introduced by coercion 
# 2: NAs introduced by coercion 
# 3: NAs introduced by coercion 

# warn = 2 -- warnings as errors
options(warn=2)
j()
# 1 
# Error: (converted from warning) NAs introduced by coercion

Ответ 2

R позволяет определить обработчик условий

x <- tryCatch({
    warning("oops")
}, warning=function(w) {
    ## do something about the warning, maybe return 'NA'
    message("handling warning: ", conditionMessage(w))
    NA
})

что приводит к

handling warning: oops
> x
[1] NA

Выполнение продолжается после tryCatch; вы можете решить закончить, переведя свое предупреждение на ошибку

x <- tryCatch({
    warning("oops")
}, warning=function(w) {
    stop("converted from warning: ", conditionMessage(w))
})

или обработать условие изящно (постоянная оценка после предупредительного вызова)

withCallingHandlers({
    warning("oops")
    1
}, warning=function(w) {
    message("handled warning: ", conditionMessage(w))
    invokeRestart("muffleWarning")
})

который печатает

handled warning: oops
[1] 1

Ответ 3

Установите глобальную опцию warn:

options(warn=1)  # print warnings as they occur
options(warn=2)  # treat warnings as errors

Обратите внимание, что "предупреждение" не является "ошибкой". Циклы не заканчиваются для предупреждений (кроме options(warn=2)).