Печать массива numpy без эллипсиса

Я хочу напечатать массив numpy без усечения. Я видел другие решения, но они, похоже, не работают.

Вот фрагмент кода:

total_list = np.array(total_list)
np.set_printoptions(threshold=np.inf)
print(total_list)

И это выглядит так:

22        A
23        G
24        C
25        T
26        A
27        A
28        A
29        G
         ..
232272    G
232273    T
232274    G
232275    C
232276    T
232277    C
232278    G
232279    T

Это весь код. Возможно, я ошибаюсь в литье.

import csv
import pandas as pd
import numpy as np



seqs = pd.read_csv('BAP_GBS_BTXv2_imp801.hmp.csv')
plts = pd.read_csv('BAP16_PlotPlan.csv')

required_rows = np.array([7,11,14,19,22,31,35,47,50,55,58,63,66,72,74,79,82,87,90,93,99])
total_list = []


for i in range(len(required_rows)):
    curr_row = required_rows[i];
    print(curr_row)
    for j in range(len(plts.RW)):
        if(curr_row == plts.RW[j]):
            curr_plt = plts.PI[j]
            curr_range = plts.RA1[j]
            curr_plt = curr_plt.replace("_", "").lower()
            if curr_plt in seqs.columns:
                new_item = [curr_row,curr_range,seqs[curr_plt]]
                total_list.append(new_item)
                print(seqs[curr_plt]) 


total_list = np.array(total_list)
'''
np.savetxt("foo.csv", total_list[:,2], delimiter=',',fmt='%s')
total_list[:,2].tofile('seqs.csv',sep=',',format='%s')
'''
np.set_printoptions(threshold='nan')

print(total_list)

Ответы

Ответ 1

используйте следующий фрагмент, чтобы получить многоточие.

import numpy
numpy.set_printoptions(threshold=numpy.nan)

РЕДАКТИРОВАТЬ:

Если у вас есть pandas.DataFrame используйте следующий фрагмент для печати вашего массива:

def print_full(x):
    pd.set_option('display.max_rows', len(x))
    print(x)
    pd.reset_option('display.max_rows')

Или вы можете использовать метод pandas.DataFrame.to_string(), чтобы получить желаемый результат.

РЕДАКТИРОВАТЬ':

Более ранняя версия этого поста предложила вариант ниже

numpy.set_printoptions(threshold='nan')

Технически это может сработать, однако в пустой документации указываются int и None как разрешенные типы. Ссылка: https://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.set_printoptions.html.

Ответ 2

Вы можете обойти странное поведение Ret/печати Numpy, изменив его на list:

print list(total_list)

должен распечатать список 2-элементных np-массивов.

Ответ 3

Вы печатаете массивы numpy не.

Добавьте следующую строку после импорта:

pd.set_option('display.max_rows', 100000)

Ответ 4

#for a 2d array
def print_full(x):
    dim = x.shape
    pd.set_option('display.max_rows', dim[0])#dim[0] = len(x)
    pd.set_option('display.max_columns', dim[1])
    print(x)
    pd.reset_option('display.max_rows')
    pd.reset_option('display.max_columns')