Выберите первую и последнюю строку из сгруппированных данных

Вопрос

Используя dplyr, как я могу выбрать верхние и нижние наблюдения/строки сгруппированных данных в одном выражении?

Данные и пример

С учетом кадра данных

df <- data.frame(id=c(1,1,1,2,2,2,3,3,3), 
                 stopId=c("a","b","c","a","b","c","a","b","c"), 
                 stopSequence=c(1,2,3,3,1,4,3,1,2))

Я могу получить верхние и нижние наблюдения из каждой группы, используя slice, но используя две отдельные записи:

firstStop <- df %>%
  group_by(id) %>%
  arrange(stopSequence) %>%
  slice(1) %>%
  ungroup

lastStop <- df %>%
  group_by(id) %>%
  arrange(stopSequence) %>%
  slice(n()) %>%
  ungroup

Можно ли объединить эти два statmenets в один, который отображает как верхние, так и нижние наблюдения?

Ответы

Ответ 1

Вероятно, существует более быстрый способ:

df %>%
  group_by(id) %>%
  arrange(stopSequence) %>%
  filter(row_number()==1 | row_number()==n())

Ответ 2

Только для полноты: вы можете передать slice вектор индексов:

df %>% arrange(stopSequence) %>% group_by(id) %>% slice(c(1,n()))

который дает

  id stopId stopSequence
1  1      a            1
2  1      c            3
3  2      b            1
4  2      c            4
5  3      b            1
6  3      a            3

Ответ 3

Не dplyr, но гораздо более прямое использование data.table:

library(data.table)
setDT(df)
df[ df[order(id, stopSequence), .I[c(1L,.N)], by=id]$V1 ]
#    id stopId stopSequence
# 1:  1      a            1
# 2:  1      c            3
# 3:  2      b            1
# 4:  2      c            4
# 5:  3      b            1
# 6:  3      a            3

Более подробное объяснение:

# 1) get row numbers of first/last observations from each group
#    * basically, we sort the table by id/stopSequence, then,
#      grouping by id, name the row numbers of the first/last
#      observations for each id; since this operation produces
#      a data.table
#    * .I is data.table shorthand for the row number
#    * here, to be maximally explicit, I've named the variable V1
#      as row_num to give other readers of my code a clearer
#      understanding of what operation is producing what variable
first_last = df[order(id, stopSequence), .(row_num = .I[c(1L,.N)]), by=id]
idx = first_last$row_num

# 2) extract rows by number
df[idx]

Обязательно ознакомьтесь с Getting Started wiki для получения основных data.table

Ответ 4

Что-то вроде:

library(dplyr)

df <- data.frame(id=c(1,1,1,2,2,2,3,3,3),
                 stopId=c("a","b","c","a","b","c","a","b","c"),
                 stopSequence=c(1,2,3,3,1,4,3,1,2))

first_last <- function(x) {
  bind_rows(slice(x, 1), slice(x, n()))
}

df %>%
  group_by(id) %>%
  arrange(stopSequence) %>%
  do(first_last(.)) %>%
  ungroup

## Source: local data frame [6 x 3]
## 
##   id stopId stopSequence
## 1  1      a            1
## 2  1      c            3
## 3  2      b            1
## 4  2      c            4
## 5  3      b            1
## 6  3      a            3

С помощью do вы можете в значительной степени выполнять любое количество операций в группе, но ответ @jeremycg более подходит для этой задачи.

Ответ 5

Я знаю заданный вопрос dplyr. Но, поскольку другие уже размещали решения с использованием других пакетов, я решил также использовать другие пакеты:

Базовый пакет:

df <- df[with(df, order(id, stopSequence, stopId)), ]
merge(df[!duplicated(df$id), ], 
      df[!duplicated(df$id, fromLast = TRUE), ], 
      all = TRUE)

data.table:

df <-  setDT(df)
df[order(id, stopSequence)][, .SD[c(1,.N)], by=id]

sqldf:

library(sqldf)
min <- sqldf("SELECT id, stopId, min(stopSequence) AS StopSequence
      FROM df GROUP BY id 
      ORDER BY id, StopSequence, stopId")
max <- sqldf("SELECT id, stopId, max(stopSequence) AS StopSequence
      FROM df GROUP BY id 
      ORDER BY id, StopSequence, stopId")
sqldf("SELECT * FROM min
      UNION
      SELECT * FROM max")

В одном запросе:

sqldf("SELECT * 
        FROM (SELECT id, stopId, min(stopSequence) AS StopSequence
              FROM df GROUP BY id 
              ORDER BY id, StopSequence, stopId)
        UNION
        SELECT *
        FROM (SELECT id, stopId, max(stopSequence) AS StopSequence
              FROM df GROUP BY id 
              ORDER BY id, StopSequence, stopId)")

Вывод:

  id stopId StopSequence
1  1      a            1
2  1      c            3
3  2      b            1
4  2      c            4
5  3      a            3
6  3      b            1

Ответ 6

Использование data.table:

# convert to data.table
setDT(df) 
# order, group, filter
df[order(stopSequence)][, .SD[c(1, .N)], by = id]

   id stopId stopSequence
1:  1      a            1
2:  1      c            3
3:  2      b            1
4:  2      c            4
5:  3      b            1
6:  3      a            3

Ответ 7

Другой подход с lapply и выражением dplyr. Мы можем применить произвольное число любых итоговых функций к одному и тому же утверждению:

lapply(c(first, last), 
       function(x) df %>% group_by(id) %>% summarize_all(funs(x))) %>% 
bind_rows()

Например, вы можете быть заинтересованы в строках со значением max stopSequence и сделать:

lapply(c(first, last, max("stopSequence")), 
       function(x) df %>% group_by(id) %>% summarize_all(funs(x))) %>%
bind_rows()

Ответ 8

Другая базовая альтернатива R будет заключаться в том, чтобы сначала order использовать id и stopSequence, split их, основываясь на id, и для каждого id мы выбираем только первый и последний индексы и подбираем кадр данных, используя те индексы.

df[sapply(with(df, split(order(id, stopSequence), id)), function(x) 
                   c(x[1], x[length(x)])), ]


#  id stopId stopSequence
#1  1      a            1
#3  1      c            3
#5  2      b            1
#6  2      c            4
#8  3      b            1
#7  3      a            3

Или аналогично, используя by

df[unlist(with(df, by(order(id, stopSequence), id, function(x) 
                   c(x[1], x[length(x)])))), ]