Я не могу понять, как расположить два бок о бок, как описано в руководстве пользователя критре, стр. 2 (http://yihui.name/knitr/demo/graphics/), Я использую следующий MWE, и выход ниже. Я бы хотел, чтобы они были выровнены, как показано в руководстве для двух автомобильных участков (также на стр. 2 руководства). PDF создается в RStudio (Вязать в PDF).
---
title: "Untitled"
output: pdf_document
---
## R Markdown
```{r,echo=FALSE,out.width='.49\\linewidth', fig.width=3, fig.height=3}
barplot(1:4)
barplot(4:7)
```
Чтобы центрировать два сюжета, вы можете добавить fig.align='center' в свои параметры фрагмента. Если он создает один график над другим, добавьте также fig.show='hold'. Результатом должны быть два центрированных графика. 
Итак, вы, последний вариант, должны выглядеть примерно так:
{r,echo=FALSE, out.width='.49\\linewidth', fig.width=3, fig.height=3,fig.show='hold',fig.align='center'}