Экспорт python scikit изучает модели в pmml

Ответ 1

SkLearn2PMML

тонкая оболочка вокруг приложения командной строки JPMML-SkLearn. Список поддерживаемых типов Scikit-Learn Estimator и Transformer см. В документации по проекту JPMML-SkLearn.

Как отмечает @user1808924, он поддерживает Python 2.7 или 3.4+. Он также требует Java 1.7 +

Установлен через: (требуется git)

pip install git+https://github.com/jpmml/sklearn2pmml.git

Пример того, как экспортировать дерево классификатора в PMML. Сначала вырастите дерево:

# example tree & viz from http://scikit-learn.org/stable/modules/tree.html
from sklearn import datasets, tree
iris = datasets.load_iris()
clf = tree.DecisionTreeClassifier() 
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)

Есть две части преобразования SkLearn2PMML, оценщик (наш clf) и картограф (для шагов предварительной обработки, таких как дискретизация или PCA). Наш картограф довольно простой, поскольку мы не делаем никаких преобразований.

from sklearn_pandas import DataFrameMapper
default_mapper = DataFrameMapper([(i, None) for i in iris.feature_names + ['Species']])

from sklearn2pmml import sklearn2pmml
sklearn2pmml(estimator=clf, 
             mapper=default_mapper, 
             pmml="D:/workspace/IrisClassificationTree.pmml")

Возможно (хотя и не документировано) пройти mapper=None, но вы увидите, что имена предикторов теряются (возврат x1 not sepal length и т.д.).

Посмотрите на файл .pmml:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" standalone="yes"?>
<PMML xmlns="http://www.dmg.org/PMML-4_3" version="4.3">
    <Header>
        <Application name="JPMML-SkLearn" version="1.1.1"/>
        <Timestamp>2016-09-26T19:21:43Z</Timestamp>
    </Header>
    <DataDictionary>
        <DataField name="sepal length (cm)" optype="continuous" dataType="float"/>
        <DataField name="sepal width (cm)" optype="continuous" dataType="float"/>
        <DataField name="petal length (cm)" optype="continuous" dataType="float"/>
        <DataField name="petal width (cm)" optype="continuous" dataType="float"/>
        <DataField name="Species" optype="categorical" dataType="string">
            <Value value="setosa"/>
            <Value value="versicolor"/>
            <Value value="virginica"/>
        </DataField>
    </DataDictionary>
    <TreeModel functionName="classification" splitCharacteristic="binarySplit">
        <MiningSchema>
            <MiningField name="Species" usageType="target"/>
            <MiningField name="sepal length (cm)"/>
            <MiningField name="sepal width (cm)"/>
            <MiningField name="petal length (cm)"/>
            <MiningField name="petal width (cm)"/>
        </MiningSchema>
        <Output>
            <OutputField name="probability_setosa" dataType="double" feature="probability" value="setosa"/>
            <OutputField name="probability_versicolor" dataType="double" feature="probability" value="versicolor"/>
            <OutputField name="probability_virginica" dataType="double" feature="probability" value="virginica"/>
        </Output>
        <Node id="1">
            <True/>
            <Node id="2" score="setosa" recordCount="50.0">
                <SimplePredicate field="petal width (cm)" operator="lessOrEqual" value="0.8"/>
                <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="50.0"/>
                <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="0.0"/>
                <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="0.0"/>
            </Node>
            <Node id="3">
                <SimplePredicate field="petal width (cm)" operator="greaterThan" value="0.8"/>
                <Node id="4">
                    <SimplePredicate field="petal width (cm)" operator="lessOrEqual" value="1.75"/>
                    <Node id="5">
                        <SimplePredicate field="petal length (cm)" operator="lessOrEqual" value="4.95"/>
                        <Node id="6" score="versicolor" recordCount="47.0">
                            <SimplePredicate field="petal width (cm)" operator="lessOrEqual" value="1.6500001"/>
                            <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="0.0"/>
                            <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="47.0"/>
                            <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="0.0"/>
                        </Node>
                        <Node id="7" score="virginica" recordCount="1.0">
                            <SimplePredicate field="petal width (cm)" operator="greaterThan" value="1.6500001"/>
                            <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="0.0"/>
                            <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="0.0"/>
                            <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="1.0"/>
                        </Node>
                    </Node>
                    <Node id="8">
                        <SimplePredicate field="petal length (cm)" operator="greaterThan" value="4.95"/>
                        <Node id="9" score="virginica" recordCount="3.0">
                            <SimplePredicate field="petal width (cm)" operator="lessOrEqual" value="1.55"/>
                            <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="0.0"/>
                            <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="0.0"/>
                            <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="3.0"/>
                        </Node>
                        <Node id="10">
                            <SimplePredicate field="petal width (cm)" operator="greaterThan" value="1.55"/>
                            <Node id="11" score="versicolor" recordCount="2.0">
                                <SimplePredicate field="sepal length (cm)" operator="lessOrEqual" value="6.95"/>
                                <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="0.0"/>
                                <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="2.0"/>
                                <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="0.0"/>
                            </Node>
                            <Node id="12" score="virginica" recordCount="1.0">
                                <SimplePredicate field="sepal length (cm)" operator="greaterThan" value="6.95"/>
                                <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="0.0"/>
                                <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="0.0"/>
                                <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="1.0"/>
                            </Node>
                        </Node>
                    </Node>
                </Node>
                <Node id="13">
                    <SimplePredicate field="petal width (cm)" operator="greaterThan" value="1.75"/>
                    <Node id="14">
                        <SimplePredicate field="petal length (cm)" operator="lessOrEqual" value="4.8500004"/>
                        <Node id="15" score="virginica" recordCount="2.0">
                            <SimplePredicate field="sepal width (cm)" operator="lessOrEqual" value="3.1"/>
                            <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="0.0"/>
                            <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="0.0"/>
                            <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="2.0"/>
                        </Node>
                        <Node id="16" score="versicolor" recordCount="1.0">
                            <SimplePredicate field="sepal width (cm)" operator="greaterThan" value="3.1"/>
                            <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="0.0"/>
                            <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="1.0"/>
                            <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="0.0"/>
                        </Node>
                    </Node>
                    <Node id="17" score="virginica" recordCount="43.0">
                        <SimplePredicate field="petal length (cm)" operator="greaterThan" value="4.8500004"/>
                        <ScoreDistribution value="setosa" recordCount="0.0"/>
                        <ScoreDistribution value="versicolor" recordCount="0.0"/>
                        <ScoreDistribution value="virginica" recordCount="43.0"/>
                    </Node>
                </Node>
            </Node>
        </Node>
    </TreeModel>
</PMML>

Первый сплит (Node 1) находится на ширине лепестков 0,8. Node 2 (ширина лепестка <= 0,8) захватывает всю сеттозу, и ничего больше.

Вы можете сравнить выход pmml с выходом graphviz:

from sklearn.externals.six import StringIO
import pydotplus # this might be pydot for python 2.7
dot_data = StringIO() 
tree.export_graphviz(clf, 
                     out_file=dot_data,  
                     feature_names=iris.feature_names,  
                     class_names=iris.target_names,  
                     filled=True, rounded=True,  
                     special_characters=True) 
graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
graph.write_pdf("D:/workspace/iris.pdf") 
# for in-line display, you can also do:
# from IPython.display import Image  
# Image(graph.create_png())  

Ответ 2

Не стесняйтесь попробовать Nyoka. Экспорт моделей SKL, а затем некоторые.

Ответ 3

Nyoka библиотека питон, имеющий поддержку Scikit-learn, XGBoost, LightGBM, Keras и Statsmodels.

Помимо примерно 500 классов Python, каждый из которых охватывает тег PMML и все параметры/атрибуты конструктора, как определено в стандарте, Nyoka также предоставляет растущее число удобных классов и функций, которые облегчают жизнь Data Scientists, например, путем чтения или записи любого файла PMML. в одной строке кода в вашей любимой среде Python.

Его можно установить из PyPi, используя:

pip install nyoka

Пример кода

Пример 1

import pandas as pd
from sklearn import datasets
from sklearn.pipeline import Pipeline
from sklearn.preprocessing import StandardScaler, Imputer
from sklearn_pandas import DataFrameMapper
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier

iris = datasets.load_iris()
irisd = pd.DataFrame(iris.data, columns=iris.feature_names)
irisd['Species'] = iris.target

features = irisd.columns.drop('Species')
target = 'Species'

pipeline_obj = Pipeline([
    ("mapping", DataFrameMapper([
    (['sepal length (cm)', 'sepal width (cm)'], StandardScaler()) , 
    (['petal length (cm)', 'petal width (cm)'], Imputer())
    ])),
    ("rfc", RandomForestClassifier(n_estimators = 100))
])

pipeline_obj.fit(irisd[features], irisd[target])

from nyoka import skl_to_pmml

skl_to_pmml(pipeline_obj, features, target, "rf_pmml.pmml")

Пример 2

from keras import applications
from keras.layers import Flatten, Dense
from keras.models import Model

model = applications.MobileNet(weights='imagenet', include_top=False,input_shape = (224, 224,3))

activType='sigmoid'
x = model.output
x = Flatten()(x)
x = Dense(1024, activation="relu")(x)
predictions = Dense(2, activation=activType)(x)
model_final = Model(inputs =model.input, outputs = predictions,name='predictions')

from nyoka import KerasToPmml
cnn_pmml = KerasToPmml(model_final,dataSet='image',predictedClasses=['cats','dogs'])

cnn_pmml.export(open('2classMBNet.pmml', "w"), 0)

Больше примеров можно найти на странице Nyoka Github.