Получить коэффициенты, оцениваемые по максимальной вероятности, в таблицу stargazer
Stargazer производит очень приятные латексные столы для объектов lm (и других). Предположим, что я поместил модель по максимальной вероятности. Я бы хотел, чтобы stargazer создал lm-подобную таблицу для моих оценок. Как я могу это сделать?
Хотя это немного взломанно, одним из способов может быть создание "поддельного" lm-объекта, содержащего мои оценки - я думаю, что это будет работать до тех пор, пока работает summary (my.fake.lm.object). Это легко выполнимо?
Пример:
library(stargazer)
N <- 200
df <- data.frame(x=runif(N, 0, 50))
df$y <- 10 + 2 * df$x + 4 * rt(N, 4) # True params
plot(df$x, df$y)
model1 <- lm(y ~ x, data=df)
stargazer(model1, title="A Model") # I'd like to produce a similar table for the model below
ll <- function(params) {
## Log likelihood for y ~ x + student t errors
params <- as.list(params)
return(sum(dt((df$y - params$const - params$beta*df$x) / params$scale, df=params$degrees.freedom, log=TRUE) -
log(params$scale)))
}
model2 <- optim(par=c(const=5, beta=1, scale=3, degrees.freedom=5), lower=c(-Inf, -Inf, 0.1, 0.1),
fn=ll, method="L-BFGS-B", control=list(fnscale=-1), hessian=TRUE)
model2.coefs <- data.frame(coefficient=names(model2$par), value=as.numeric(model2$par),
se=as.numeric(sqrt(diag(solve(-model2$hessian)))))
stargazer(model2.coefs, title="Another Model", summary=FALSE) # Works, but how can I mimic what stargazer does with lm objects?
Чтобы быть более точным: с объектами lm, stargazer красиво печатает зависимую переменную в верхней части таблицы, включает SE в скобках ниже соответствующих оценок и имеет R ^ 2 и количество наблюдений в нижней части таблицы, Существует ли (простой способ) получить такое же поведение с "настраиваемой" моделью, оцененной по максимальной вероятности, как указано выше?
Вот мои слабые попытки придумать мой оптимальный вывод как объект lm:
model2.lm <- list() # Mimic an lm object
class(model2.lm) <- c(class(model2.lm), "lm")
model2.lm$rank <- model1$rank # Problematic?
model2.lm$coefficients <- model2$par
names(model2.lm$coefficients)[1:2] <- names(model1$coefficients)
model2.lm$fitted.values <- model2$par["const"] + model2$par["beta"]*df$x
model2.lm$residuals <- df$y - model2.lm$fitted.values
model2.lm$model <- df
model2.lm$terms <- model1$terms # Problematic?
summary(model2.lm) # Not working
Ответы
Ответ 1
Я не знаю, насколько вы привержены использованию stargazer, но вы можете попробовать использовать метлу и xtable-пакеты, проблема в том, что она не даст вам стандартных ошибок для оптимальной модели
library(broom)
library(xtable)
xtable(tidy(model1))
xtable(tidy(model2))
Ответ 2
У меня была эта проблема, и я преодолел это с помощью функций coef
se
и omit
в пределах stargazer... например.
stargazer(regressions, ...
coef = list(... list of coefs...),
se = list(... list of standard errors...),
omit = c(sequence),
covariate.labels = c("new names"),
dep.var.labels.include = FALSE,
notes.append=FALSE), file="")
Ответ 3
Сначала нужно создать экземпляр фиктивного объекта lm
, а затем одеть его:
#...
model2.lm = lm(y ~ ., data.frame(y=runif(5), beta=runif(5), scale=runif(5), degrees.freedom=runif(5)))
model2.lm$coefficients <- model2$par
model2.lm$fitted.values <- model2$par["const"] + model2$par["beta"]*df$x
model2.lm$residuals <- df$y - model2.lm$fitted.values
stargazer(model2.lm, se = list(model2.coefs$se), summary=FALSE, type='text')
# ===============================================
# Dependent variable:
# ---------------------------
# y
# -----------------------------------------------
# const 10.127***
# (0.680)
#
# beta 1.995***
# (0.024)
#
# scale 3.836***
# (0.393)
#
# degrees.freedom 3.682***
# (1.187)
#
# -----------------------------------------------
# Observations 200
# R2 0.965
# Adjusted R2 0.858
# Residual Std. Error 75.581 (df = 1)
# F Statistic 9.076 (df = 3; 1)
# ===============================================
# Note: *p<0.1; **p<0.05; ***p<0.01
(и, конечно же, убедитесь, что оставшаяся итоговая статистика верна)