Объединить несколько файлов
Я использую стандартную команду соединения для объединения двух отсортированных файлов на основе столбца1.
Команда проста: join file1 file2 > output_file.
Но как мне присоединиться к 3 или более файлам с использованием того же метода?
join file1 file2 file3 > output_file
Команда выше дала мне пустой файл.
Я думаю, что sed может мне помочь, но я не слишком уверен, как?
Ответы
Ответ 1
man join
:
NAME
join - join lines of two files on a common field
SYNOPSIS
join [OPTION]... FILE1 FILE2
он работает только с двумя файлами.
если вам нужно присоединиться к трем, возможно, вы можете сначала присоединиться к первым двум, а затем присоединиться к третьему.
попробовать:
join file1 file2 | join - file3 > output
который должен присоединиться к трем файлам без создания промежуточного временного файла. -
сообщает команде соединения прочитать первый входной поток из stdin
Ответ 2
Можно объединить несколько файлов (N >= 2), построив конвейер join
рекурсивно:
#!/bin/sh
# multijoin - join multiple files
join_rec() {
if [ $# -eq 1 ]; then
join - "$1"
else
f=$1; shift
join - "$f" | join_rec "[email protected]"
fi
}
if [ $# -le 2 ]; then
join "[email protected]"
else
f1=$1; f2=$2; shift 2
join "$f1" "$f2" | join_rec "[email protected]"
fi
Ответ 3
Я знаю, что это старый вопрос, но для будущего использования.
Если вы знаете, что файлы, к которым вы хотите присоединиться, имеют шаблон, похожий на вопрос здесь, например. file1 file2 file3 ... fileN
Затем вы можете просто присоединиться к ним с помощью этой команды
cat file* > output
Где вывод будет серией связанных файлов, которые были объединены в алфавитном порядке.
Ответ 4
Я создал для этого функцию. Первый аргумент - это выходной файл, остальные аргументы - файлы, которые нужно объединить.
function multijoin() {
out=$1
shift 1
cat $1 | awk '{print $1}' > $out
for f in $*; do join $out $f > tmp; mv tmp $out; done
}
Использование:
multijoin output_file file*
Ответ 5
На странице man
join
указано, что он работает только для двух файлов. Поэтому вам нужно создать и промежуточный файл, который вы удаляете впоследствии, т.е.:
> join file1 file2 > temp
> join temp file3 > output
> rm output
Ответ 6
Хотя немного старый вопрос, так вы можете сделать это с помощью одного awk
:
awk -v j=<field_number> '{key=$j; $j=""} # get key and delete field j
(NR==FNR){order[FNR]=key;} # store the key-order
{entry[key]=entry[key] OFS $0 } # update key-entry
END { for(i=1;i<=FNR;++i) {
key=order[i]; print key entry[key] # print
}
}' file1 ... filen
Этот сценарий предполагает:
- все файлы имеют одинаковое количество строк
- порядок вывода - это тот же порядок первого файла.
- файлы не нужно сортировать в поле
<field_number>
-
<field_number>
- допустимое целое число.
Ответ 7
Соединение объединяет строки двух файлов в общем поле. Если вы хотите присоединиться к другому - делайте это парами. Сначала присоедините первые два файла, затем присоедините результат к третьему файлу и т.д.
Ответ 8
Предполагая, что у вас есть четыре файла A.txt, B.txt, C.txt и D.txt:
~$ cat A.txt
x1 2
x2 3
x4 5
x5 8
~$ cat B.txt
x1 5
x2 7
x3 4
x4 6
~$ cat C.txt
x2 1
x3 1
x4 1
x5 1
~$ cat D.txt
x1 1
Присоединитесь к файлам с помощью:
firstOutput='0,1.2'; secondOutput='2.2'; myoutput="$firstOutput,$secondOutput"; outputCount=3; join -a 1 -a 2 -e 0 -o "$myoutput" A.txt B.txt > tmp.tmp; for f in C.txt D.txt; do firstOutput="$firstOutput,1.$outputCount"; myoutput="$firstOutput,$secondOutput"; join -a 1 -a 2 -e 0 -o "$myoutput" tmp.tmp $f > tempf; mv tempf tmp.tmp; outputCount=$(($outputCount+1)); done; mv tmp.tmp files_join.txt
Результаты:
~$ cat files_join.txt
x1 2 5 0 1
x2 3 7 1 0
x3 0 4 1 0
x4 5 6 1 0
x5 8 0 1 0