Форматирование графика persp3d

У меня есть следующий трехмерный график:

ro

С помощью данных я создал его со следующим кодом:

library(rugarch)
library(rgl)
library(fGarch)

fd <- as.data.frame(modelfit, which = 'density')
color <- rgb(85, 141, 85, maxColorValue=255)

x <- seq(-0.2, 0.2, length=100)
y <-c(1:2318)

f <- function(s, t) {
 dged(s,mean=fd[t,'Mu'],sd=fd[t,'Sigma'],nu=fd[t,'Shape'])

}

z <- outer(x, y, f)
persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color,
      ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=TRUE)

Как я могу получить раскраску в зависимости от значений z? Я рассмотрел различные решения, например. этот один, но я не мог создать раскраску в зависимости от значений z в этом случае. Решение в соответствии с этой нитью было бы следующим:

nrz <- nrow(z)
ncz <- ncol(z)
jet.colors <- colorRampPalette( c("#ffcccc", "#cc0000") ) 
# Generate the desired number of colors from this palette
nbcol <- 100
color <- jet.colors(nbcol)

# Compute the z-value at the facet centres
zfacet <- z[-1, -1] + z[-1, -ncz] + z[-nrz, -1] + z[-nrz, -ncz]
# Recode facet z-values into color indices
facetcol <- cut(zfacet, nbcol)

  persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color[facetcol],
          ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=TRUE)

Но это не дает хорошего результата, поскольку он не окрашивает сюжет. Я хочу, чтобы шипы моей поверхности были, например, в красном и низкие значения, например, в синем с приятным плавным переходом, но этот цвет расцветает, так что в зависимости от времени? Поэтому экстремальные большие всплески должны быть окрашены красными пиками и значениями внизу, например. в зеленом цвете. Как я могу получить это?

Изменить: я нашел решение своего предыдущего вопроса о дате на оси, единственная проблема, оставшаяся, - это соответствующая раскраска, зависящая от значений z.

Ответы

Ответ 1

Попробуйте следующее:

nbcol = 100
color = rev(rainbow(nbcol, start = 0/6, end = 4/6))
zcol  = cut(z, nbcol)
persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color[zcol],
        ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=TRUE)

theplot

Если вы хотите, чтобы раскраска была по времени (так что пики всегда красные), вы можете установить расцветку для каждого временного фрагмента:

mycut = function(x, breaks) as.numeric(cut(x=x, breaks=breaks)) # to combine different factors
zcol2 = as.numeric(apply(z,2, mycut, breaks=nbcol)) 
persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color[zcol2],
        ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=TRUE)

theplot2

Вы уже знаете, как правильно отредактировать оси.

Ответ 2

Чтобы утвердить контроль над осями, вам нужно установить axes=FALSE (как было сказано вчера) в вызове persp3d, а затем использовать функции axes3d и axis3d с аргументами по вашему выбору. Чтобы указать ось x со значениями, отображаемыми вдоль нижнего сегмента yz-box, используйте edge= 'x--'. Чтобы пометить ось y с именами ростов, используйте аргументы 'labels' и 'at':

plot3d ( ..., axes=FALSE, ...)
# repositions x axis and draws default z axis
axes3d(c('x--','z'))  
# Use custom labels
axis3d(edge= 'y+-', at =seq(500,2000,by=500), 
                    labels = rownames(fd)[seq(500,2000,by=500)] )

enter image description here

(Примечание: Чтобы играть в эту игру SO правильно, вам нужно отдать должное другим, которые предложили помощь. Это не сильно отличается от со вчерашнего вопроса и Я не вижу положительного ответа на полезный вклад. Мне интересно, не становятся ли люди незаинтересованными.)

Ответ 3

Ниже приведено решение ответить на ваш вопрос о окрашивании поверхности в зависимости от значений z. Идея состоит в том, чтобы назначить цвет каждой точке поверхности на основании ее (относительной) высоты. Код ниже включает настройку осей, предложенную @DWin.

library(rugarch)
library(rgl)
library(fGarch)

fd <- as.data.frame(modelfit, which = 'density')
x  <- seq(-0.2, 0.2, length=100)
y  <- c(1:2318)

f <- function(s, t) {
    dged(s,mean=fd[t,'Mu'],sd=fd[t,'Sigma'],nu=fd[t,'Shape'])
}

z <- outer(x, y, f)

## Color definition of each point of the surface
height <- (z - range(z)[1]) / diff(range(z))
r.prop <- height
g.prop <- 0
b.prop <- 1 - height
color  <- rgb(r.prop, g.prop, b.prop, maxColorValue=1)

persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color,
        ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=FALSE)
axes3d(c('x--','z'))  
# Use custom labels
axis3d(edge= 'y+-', at =seq(500,2000,by=500), 
       labels = rownames(fd)[seq(500,2000,by=500)] )

theplot