Использование stargazer с Rstudio и Knitr

Я пытаюсь использовать вывод stargazer в knitr, используя RStudio. Например, я вставляю код ниже в .Rmd файл и затем вязать HTML. Первый блок между [и] представляется как уравнения. Второй блок - от звезды. Он остается в коде. Когда я вставляю второй блок, меньше [и], в файл Sweave и затем компилирую его в формате PDF, код отображается как таблица. У меня установлен MikTex и версия 3 Stargazer.

Ответ inserting stargazer или xable table в документ knitr работает для меня в файле Sweave (Rnw) при нажатии на компиляцию PDF. В файле Rmd tex не отображается при нажатии Knit HTML.

Как я могу поместить вывод stargazer в Rmd файл, чтобы Knit HTML конвертировал латексный код в таблицу? (Я новичок в Latex и не знаю, какой код я могу удалить, поэтому извиняюсь за длинный сегмент.)

\[
\begin{aligned}
\dot{x} &amp; = \sigma(y-x) \\
\dot{y} &amp; = \rho x - y - xz \\
\dot{z} &amp; = -\beta z + xy
\end{aligned}
\]

\[
\documentclass{article}

\begin{document}


% Table created by StarGazer v.3.0.1 by Marek Hlavac, Harvard University. E-mail: hlavac at fas.harvard.edu
% Date and time: Sun, Feb 03, 2013 - 11:34:52 AM
\begin{table}[htb] \centering 
  \caption{} 
  \label{} 
\footnotesize 

\begin{tabular}{@{\extracolsep{5pt}}lc} 
\\[-1.8ex]\hline 
\hline \\[-1.8ex] 
 & \multicolumn{1}{c}{\textit{Dependent variable:}} \\ 
\cline{2-2} 
\\[-1.8ex] & Rate \\ 
\hline \\[-1.8ex] 
 pole & $0.071^{***}$ \\ 
  & $(0.020)$ \\ 
  & \\ 
 post & $0.095^{***}$ \\ 
  & $(0.019)$ \\ 
  & \\ 
 Constant & $-5.784^{***}$ \\ 
  & $(1.667)$ \\ 
  & \\ 
\hline \\[-1.8ex] 
Observations & $46$ \\ 
Residual Std. Error & $2.378 (df = 43)$ \\ 
\hline 
\hline \\[-1.8ex] 
\textit{Note:}  & \multicolumn{1}{r}{$^{*}$p$<$0.1; $^{**}$p$<$0.05; $^{***}$p$<$0.01} \\ 
\normalsize 
\end{tabular} 
\end{table} 

\end{document}
\]

Ответы

Ответ 1

Так как тема немного устарела, я предполагаю, что проблема заключается в том, чтобы каким-то образом использовать stargazer с knitr, а не по сути преобразование объектов stargazer в HTML.

Являясь активным поклонником звездного вратаря, я придумал следующий рабочий процесс:

Напишите мой код в файле .Rmd.
Вязать его в .md. Таблицы Stargazer остаются в виде кода LaTeX в результирующем файле разметки.
Используйте pandoc, чтобы преобразовать файл отметки в PDF. Pandoc переводит код LaTeX в соответствующие таблицы. В качестве альтернативы, можно использовать LyX с плагином для чтения, чтобы получить таблицы звездчатого стола, которые хорошо воспроизводятся в формате PDF.

Если вам нужны таблицы stargazer в MS Word, лучшим способом, который я нашел, является использование LaTeX2RTF. Хотя самые верхние ячейки немного искажены, фиксация - это вопрос удаления ошибочной пустой ячейки. В остальном таблица сохраняется и может быть вставлена /импортирована в Word.

Эти две стратегии помогают использовать stargazer вне LaTeX. Надеюсь, поможет.

Ответ 2

Используйте следующий код, и вы получите рабочую версию

{r, results='asis'} stargazer(model)

При преобразовании в pdf следующий код отлично работает для stargazer 4.0:

{r, results='asis'} stargazer(model, header=FALSE, type='latex')

Ответ 3

В дополнение к предыдущему ответу и, возможно, как более простому решению, stargazer может выводить таблицу в html-код, так что когда Rmd файл вязан в html, создается таблица, а не tex-код. Я считаю, что функция stargazer теперь может напрямую экспортироваться в html, установив type = 'html'.

Итак, например, данная модель подходит lm1, вы должны использовать следующий код в своем файле Rmd:

stargazer(lm1, type = 'html')

Это работает независимо от того, хотите ли вы, чтобы ваш конечный результат был html или pdf.

Ответ 4

Возвращаясь к этому вопросу.

Я хочу использовать те же файлы разметки для создания html и pdf-выходов в RStudio с knitr. То есть, в RStudio я хочу нажать кнопку трикотажа и иметь варианты вязания выхода HTMl или вывода в формате PDF. На данный момент у меня нет большого интереса в вязании слова/документа OpenOffice.

Я использовал потрясающе полезный targazer cheatsheet от Jake Russ. Это выполняет большую часть функций старгазера. Это файл R MArkdown, с опцией chunk Результаты = 'ASIS' установленный для тех кусков, которые производят вывод звездочек.

Сама команда stargazer имеет аргумент 'type'. По умолчанию используется TYPE = '' латекс В cheatsheet Jake Russ, который предназначен для создания веб-страницы, тип = 'HTML' используется повсюду.

Это не работает вообще, если вы попытаетесь связать его в pdf. Таблицы выходят как длинные списки, одна ячейка таблицы на строку, без форматирования и занимает много страниц без форматирования.

Самое маленькое изменение, которое я могу сделать, чтобы позволить мне создавать хороший PDF файл внутри RStudio, - это глобально заменить все

type='html'

type='latex'

(обратите внимание, что оба они встречаются в тексте документа, а также в командах stargazer, поэтому необходимо проявлять осторожность!)

Это работает! Насколько я вижу, PDF является верной репликой веб-страницы, которая именно то, что я хочу.

Попытка вязать документы OpenOffice, если я оставлю

type='latex'

Каждая таблица на выходе заменяется следующим текстом: -

% Table created by stargazer v.5.2 by Marek Hlavac, Harvard University. E-mail: hlavac at fas.harvard.edu % Date and time: Tue, Sep 01, 2015 - 22:22:29

Если я восстановил

type='html'

тогда каждая таблица записывается, по одной ячейке в строке, в стороне от страницы без форматирования!