Подмножество data.frame с целочисленной матрицей

Я продолжаю сталкиваться с этим, и мне интересно, есть ли там легкая работа. В некоторых ситуациях я считаю логичнее думать о подмножестве матрицы в

N <- 12
N.NA <- 6
dat <- data.frame(V1=runif(N),V2=runif(N))
sel.mat <- matrix(c(sample(seq(N),N.NA),sample(ncol(dat),N.NA,replace=TRUE)),ncol=2)

Это работает для выбора, но не для замены:

> dat[sel.mat]
[1] 0.2582569 0.8455966 0.8828083 0.5384263 0.9574810 0.5623158
> dat[sel.mat] <- NA
Error in `[<-.data.frame`(`*tmp*`, sel.mat, value = NA) : 
  only logical matrix subscripts are allowed in replacement

Я понимаю, что есть причина для сообщения об ошибке (он не знал, что делать, если у вас было несколько заметок, указывающих на один и тот же элемент), но это не останавливает R от возможности целочисленной замены на векторах (например, dat$V1[c(2,3)] <- NA).

Есть ли удобный способ разрешить замену целой матрицей?

Ответы

Ответ 1

FWIW, индексирование матрицы с заменой работает в текущем моментальном снимке R-devel (и будет частью R-3.0.0). Очевидно, кто-то из R-core имел такое же желание, как и вы.

Как описано в файле новостей R-devel:

Матричная индексация числовых кадров с помощью двухколонных числовых индексов теперь поддерживается как для замены, так и для извлечения.

Демонстрация:

dat[sel.mat]
## [1] 0.3355509 0.4114056 0.2334332 0.6597042 0.7707762 0.7783584
dat[sel.mat] <- NA
dat[sel.mat]
## [1] NA NA NA NA NA NA

R.version.string
# [1] "R Under development (unstable) (2012-12-29 r61478)"

Ответ 2

Преобразуйте его в матрицу:

dat.m <- as.matrix(dat)
dat.m[sel.mat] <- NA
> dat.m
             V1         V2
 [1,] 0.2539189         NA
 [2,] 0.5216975         NA
 [3,] 0.1206138 0.14714848
 [4,] 0.2841779 0.52352209
 [5,] 0.3965337         NA
 [6,] 0.1871074 0.23747235
 [7,] 0.2991774         NA
 [8,]        NA 0.09509202
 [9,] 0.4636460 0.59384430
[10,] 0.5493738 0.92334630
[11,] 0.7160894         NA
[12,] 0.9568567 0.80398264

Изменить объясните, почему у нас есть ошибка с data.frame

dat.m[sel.mat] <- NA

эквивалентно выполнению следующего:

temp <- dat
dat <- "[<-"(temp, sel.mat, value=NA)

 Error in `[<-.data.frame`(temp, sel.mat, value = NA) : 
 only logical matrix subscripts are allowed in replacement

теперь я могу сделать follwing, и он работает:

dat <- "[<-"(as.matrix(temp), sel.mat, value=NA)

Ответ 3

Вы можете создать логическую матрицу на основе целочисленной матрицы:

log.mat <- matrix(FALSE, nrow(dat), ncol(dat))
log.mat[sel.mat] <- TRUE

Эта матрица может использоваться для замены значений в кадре данных с помощью NA (или других значений):

is.na(dat) <- log.mat

Результат:

           V1         V2
1  0.76063534         NA
2  0.27713051 0.10593451
3  0.74301263 0.77689458
4  0.42202155         NA
5  0.54563816 0.10233017
6          NA 0.05818723
7  0.83531963 0.93805113
8  0.99316128 0.61505393
9  0.08743757         NA
10 0.95510231 0.51267338
11 0.14035257         NA
12 0.59408022         NA

Это позволяет сохранить исходный объект в виде кадра данных, позволяющего использовать столбцы разных типов.

Ответ 4

В R выражения

dat[sel.mat]
dat[sel.mat] <- NA

являются методами S3 и эквивалентны

`[.data.frame`(x=dat, i=sel.mat)
`[<-.data.frame`(x=dat, i=sel.mat, value=NA)

так как class(dat) является "data.frame".

Вы можете посмотреть исходный код

`[.data.farme`
`[<-.data.frame`

и измените его на то, что вы хотите.

В вашем случае, возможно, вы хотите:

`[<-.data.frame` <- function(x, i, j, value) {
  if (class(i) != "matrix") return(base:::`[<-.data.frame`(x, i, j, value))
  if (class(i[1]) != "integer") return(base:::`[<-.data.frame`(x, i, j, value))
  # check the length of i and value here
  if (length(value) < nrow(i)) {
    if (nrow(i) %% length(value) != 0) warning("some warning message should be here")
    value <- rep(value, nrow(i) %/% length(value) + 1)
  }
  value <- value[1:nrow(i)]
  for(index in 1:nrow(i)) {
    x[i[index,1], i[index,2]] <- value[index]
  }
  return(x)
}

попробуйте:

N <- 12
N.NA <- 6
dat <- data.frame(V1=runif(N),V2=runif(N))
sel.mat <- matrix(c(sample(seq(N),N.NA),sample(ncol(dat),N.NA,replace=TRUE)),ncol=2)
dat[sel.mat] <- NA
dat

Ответ 5

Возможно, используя цикл?

for (i in 1:nrow(sel.mat))
{
  dat[sel.mat[i,1],sel.mat[i,2]] <- NA
}

> dat
              V1         V2
    1         NA 0.27002155
    2  0.7253383         NA
    3         NA 0.63847293
    4  0.1768720 0.64586587
    5  0.3796935 0.62261843
    6  0.6751365 0.78328647
    7  0.9801140 0.82259732
    8         NA 0.08606641
    9  0.3294625 0.44110121
    10 0.2830957         NA
    11 0.6868594 0.09767882
    12 0.9802349         NA