Ответ 1
Посмотрите Примеры анимации Matplotlib. Основной трюк состоит в том, чтобы не полностью перерисовать график, а использовать интерфейс OO matplotlib и установить x/ydata линии сюжета, которую вы создали. Если вы интегрировали свой сюжет с некоторым графическим интерфейсом, например GTK, то определенно сделайте это, как это предлагается в соответствующем разделе графика, иначе вы можете помешать циклу событий вашего инструментария GUI.
Для справки, если ссылка когда-либо умирает:
from pylab import *
import time
ion()
tstart = time.time() # for profiling
x = arange(0,2*pi,0.01) # x-array
line, = plot(x,sin(x))
for i in arange(1,200):
line.set_ydata(sin(x+i/10.0)) # update the data
draw() # redraw the canvas
print 'FPS:' , 200/(time.time()-tstart)