Scala: построение сложной иерархии признаков и классов
Я недавно опубликовал несколько вопросов о SO, которые касаются Scala признаков, типов объявлений, , показывает и скрытые данные. За этими вопросами стоит мой проект по созданию программного обеспечения для моделирования биологических белковых сетей. Несмотря на чрезвычайно полезные ответы, которые приблизили меня ближе, чем когда-либо, я еще не пришел к решению для своего проекта. Несколько ответов показали, что мой дизайн ошибочен, поэтому решения на Foo
-фрагментарные вопросы не работают на практике. Здесь я отправляю более сложную (но все же значительно упрощенную) версию моей проблемы. Я надеюсь, что проблема и решение будут в целом полезными для людей, пытающихся создать сложные иерархии признаков и классов в Scala.
Высшим классом в моем проекте является правило биологической реакции. Правило описывает, как один или два реагента трансформируются реакцией. Каждый реагент представляет собой график, который имеет узлы, называемые мономерами и краями, которые соединяются между названными сайтами на мономерах. Каждый сайт также имеет состояние, в котором он может находиться. Изменить: концепция ребер была удалена из кода примера, потому что они усложняют пример, не внося большой вклад в вопрос. Правило может сказать что-то например: имеется один реагент из мономера A, связанный с мономером B через сайты a1 и b1, соответственно; связь ломается по правилу, оставляя сайты a1 и b1 несвязанными; одновременно на мономере A состояние сайта a1 изменяется с U на P. Я бы написал это как:
A(a1~U-1).B(b1-1) -> A(a1~P) + B(b1)
(Разбор строк, подобных этому в Scala, был настолько легким, что у меня закружилась голова.) -1
указывает, что связь # 1 находится между этими сайтами - это просто произвольная метка.
Вот что я имею до сих пор вместе с рассуждением о том, почему я добавил каждый компонент. Он компилируется, но только при безвозмездном использовании asInstanceOf
. Как мне избавиться от asInstanceOf
, чтобы типы соответствовали?
Я представляю правила с базовым классом:
case class Rule(
reactants: Seq[ReactantGraph], // The starting monomers and edges
producedMonomers: Seq[ProducedMonomer] // Only new monomers go here
) {
// Example method that shows different monomers being combined and down-cast
def combineIntoOneGraph: Graph = {
val all_monomers = reactants.flatMap(_.monomers) ++ producedMonomers
GraphClass(all_monomers)
}
}
Класс для графов GraphClass
имеет параметры типа, так как я могу установить ограничения на то, какие типы мономеров и ребер разрешены на определенном графе; например, не может быть ProducedMonomer
в Reactant
a Rule
. Я также хотел бы иметь возможность collect
всех Monomer
определенного типа, например ReactantMonomer
s. Я использую псевдонимы типов для управления ограничениями.
case class GraphClass[
+MonomerType <: Monomer
](
monomers: Seq[MonomerType]
) {
// Methods that demonstrate the need for a manifest on MonomerClass
def justTheProductMonomers: Seq[ProductMonomer] = {
monomers.collect{
case x if isProductMonomer(x) => x.asInstanceOf[ProductMonomer]
}
}
def isProductMonomer(monomer: Monomer): Boolean = (
monomer.manifest <:< manifest[ProductStateSite]
)
}
// The most generic Graph
type Graph = GraphClass[Monomer]
// Anything allowed in a reactant
type ReactantGraph = GraphClass[ReactantMonomer]
// Anything allowed in a product, which I sometimes extract from a Rule
type ProductGraph = GraphClass[ProductMonomer]
Класс для мономеров MonomerClass
также имеет параметры типа, так что я могу устанавливать ограничения на сайты; например, a ConsumedMonomer
не может иметь StaticStateSite
. Кроме того, мне нужно collect
всех мономеров определенного типа, чтобы, например, собрать все мономеры в правиле, которое находится в продукте, поэтому я добавляю Manifest
к каждому параметру типа.
case class MonomerClass[
+StateSiteType <: StateSite : Manifest
](
stateSites: Seq[StateSiteType]
) {
type MyType = MonomerClass[StateSiteType]
def manifest = implicitly[Manifest[_ <: StateSiteType]]
// Method that demonstrates the need for implicit evidence
// This is where it gets bad
def replaceSiteWithIntersection[A >: StateSiteType <: ReactantStateSite](
thisSite: A, // This is a member of this.stateSites
monomer: ReactantMonomer
)(
// Only the sites on ReactantMonomers have the Observed property
implicit evidence: MyType <:< ReactantMonomer
): MyType = {
val new_this = evidence(this) // implicit evidence usually needs some help
monomer.stateSites.find(_.name == thisSite.name) match {
case Some(otherSite) =>
val newSites = stateSites map {
case `thisSite` => (
thisSite.asInstanceOf[StateSiteType with ReactantStateSite]
.createIntersection(otherSite).asInstanceOf[StateSiteType]
)
case other => other
}
copy(stateSites = newSites)
case None => this
}
}
}
type Monomer = MonomerClass[StateSite]
type ReactantMonomer = MonomerClass[ReactantStateSite]
type ProductMonomer = MonomerClass[ProductStateSite]
type ConsumedMonomer = MonomerClass[ConsumedStateSite]
type ProducedMonomer = MonomerClass[ProducedStateSite]
type StaticMonomer = MonomerClass[StaticStateSite]
Моя текущая реализация для StateSite
не имеет параметров типа; это стандартная иерархия признаков, заканчивающаяся в классах, которые имеют имя и некоторые String
, которые представляют соответствующее состояние. (Будьте любезны в использовании строк для хранения состояний объектов, они на самом деле являются классами имен в моем реальном коде.) Одна из важных целей этих признаков - предоставить функциональность, которой нужны все подклассы. Ну, разве это не цель всех черт. Мои черты особенны в том, что многие из методов делают небольшие изменения в свойстве объекта, который является общим для всех подклассов признака, а затем возвращают копию. Было бы предпочтительнее, если бы тип возврата соответствовал базовому типу объекта. Хромой способ сделать это - сделать абстрактные абстрактные методы и скопировать нужные методы во все подклассы. Я не уверен в правильном способе Scala. Некоторые источники предлагают тип участника MyType
, который хранит базовый тип (показано здесь). Другие источники предполагают параметр типа представления.
trait StateSite {
type MyType <: StateSite
def name: String
}
trait ReactantStateSite extends StateSite {
type MyType <: ReactantStateSite
def observed: Seq[String]
def stateCopy(observed: Seq[String]): MyType
def createIntersection(otherSite: ReactantStateSite): MyType = {
val newStates = observed.intersect(otherSite.observed)
stateCopy(newStates)
}
}
trait ProductStateSite extends StateSite
trait ConservedStateSite extends ReactantStateSite with ProductStateSite
case class ConsumedStateSite(name: String, consumed: Seq[String])
extends ReactantStateSite {
type MyType = ConsumedStateSite
def observed = consumed
def stateCopy(observed: Seq[String]) = copy(consumed = observed)
}
case class ProducedStateSite(name: String, Produced: String)
extends ProductStateSite
case class ChangedStateSite(
name: String,
consumed: Seq[String],
Produced: String
)
extends ConservedStateSite {
type MyType = ChangedStateSite
def observed = consumed
def stateCopy(observed: Seq[String]) = copy(consumed = observed)
}
case class StaticStateSite(name: String, static: Seq[String])
extends ConservedStateSite {
type MyType = StaticStateSite
def observed = static
def stateCopy(observed: Seq[String]) = copy(static = observed)
}
Мои самые большие проблемы связаны с методами, созданными как MonomerClass.replaceSiteWithIntersection
. Многие методы делают сложный поиск определенных членов класса, затем передают эти члены другим функциям, где им сложны изменения и возвращают копию, которая затем заменяет оригинал в копии объекта более высокого уровня. Как мне параметризовать методы (или классы), чтобы вызовы были безопасными по типу? Прямо сейчас я могу получить код для компиляции только с большим количеством asInstanceOf
. Scala особенно недовольна передачей экземпляров параметра типа или члена вокруг из-за двух основных причин, которые я могу видеть: (1) параметр ковариационного типа заканчивается как входной сигнал для любого метода, который принимает их как вход, и (2) трудно убедить Scala, что метод, возвращающий копию, действительно возвращает объект с точно таким же типом, который был помещен.
Я, несомненно, оставил некоторые вещи, которые не будут понятны всем. Если есть какие-то детали, которые мне нужно добавить, или лишние детали, которые мне нужно удалить, я постараюсь быстро разобраться.
Edit
@0__ заменил replaceSiteWithIntersection
на метод, который скомпилирован без asInstanceOf
. К сожалению, я не могу найти способ вызова метода без ошибки типа. Его код по существу является первым методом в этом новом классе для MonomerClass
; Я добавил второй метод, который его вызывает.
case class MonomerClass[+StateSiteType <: StateSite/* : Manifest*/](
stateSites: Seq[StateSiteType]) {
type MyType = MonomerClass[StateSiteType]
//def manifest = implicitly[Manifest[_ <: StateSiteType]]
def replaceSiteWithIntersection[A <: ReactantStateSite { type MyType = A }]
(thisSite: A, otherMonomer: ReactantMonomer)
(implicit ev: this.type <:< MonomerClass[A])
: MonomerClass[A] = {
val new_this = ev(this)
otherMonomer.stateSites.find(_.name == thisSite.name) match {
case Some(otherSite) =>
val newSites = new_this.stateSites map {
case `thisSite` => thisSite.createIntersection(otherSite)
case other => other
}
copy(stateSites = newSites)
case None => new_this // This throws an exception in the real program
}
}
// Example method that calls the previous method
def replaceSomeSiteOnThisOtherMonomer(otherMonomer: ReactantMonomer)
(implicit ev: MyType <:< ReactantMonomer): MyType = {
// Find a state that is a current member of this.stateSites
// Obviously, a more sophisticated means of selection is actually used
val thisSite = ev(this).stateSites(0)
// I can't get this to compile even with asInstanceOf
replaceSiteWithIntersection(thisSite, otherMonomer)
}
}
Ответы
Ответ 1
Я уменьшил вашу проблему до черт, и я начинаю понимать, почему вы попадаете в проблемы с приведениями и абстрактными типами.
То, что вам действительно не хватает, это ad-hoc-полиморфизм, который вы получаете через следующее:
- Написание метода с общей подписью, основанной на неявном одном и том же родовом для делегирования работы
- Сделать неявным доступным только для определенного значения этого общего параметра, который превратится в "неявную не найденную" ошибку времени компиляции при попытке сделать что-то незаконное.
Теперь посмотрим на проблему по порядку. Во-первых, подпись вашего метода неверна по двум причинам:
-
При замене сайта вы хотите создать новый мономер нового родового типа, как и при добавлении в коллекцию объекта, который является суперклассом существующего родового типа: вы получаете новую коллекцию чей параметр типа является суперклассом. В результате вы должны получить этот новый мономер.
-
Вы не уверены, что операция даст результат (в случае, если вы действительно не сможете заменить состояние). В этом случае правильный тип: Option [T]
def replaceSiteWithIntersection[A >: StateSiteType <: ReactantStateSite]
(thisSite: A, monomer: ReactantMonomer): Option[MonomerClass[A]]
Если теперь мы увидим digger в типах ошибок, мы увидим, что ошибка этого типа возникает из этого метода:
thisSite.createIntersection
Причина проста: его подпись не согласуется с остальными вашими типами, потому что она принимает ReactantSite, но вы хотите называть ее передачей как параметр один из ваших stateSites (который имеет тип Seq [StateSiteType]), но вы не имеют гарантии, что
StateSiteType<:<ReactantSite
Теперь посмотрим, как могут помочь вам:
trait Intersector[T] {
def apply(observed: Seq[String]): T
}
trait StateSite {
def name: String
}
trait ReactantStateSite extends StateSite {
def observed: Seq[String]
def createIntersection[A](otherSite: ReactantStateSite)(implicit intersector: Intersector[A]): A = {
val newStates = observed.intersect(otherSite.observed)
intersector(newStates)
}
}
import Monomers._
trait MonomerClass[+StateSiteType <: StateSite] {
val stateSites: Seq[StateSiteType]
def replaceSiteWithIntersection[A >: StateSiteType <: ReactantStateSite](thisSite: A, otherMonomer: ReactantMonomer)(implicit intersector:Intersector[A], ev: StateSiteType <:< ReactantStateSite): Option[MonomerClass[A]] = {
def replaceOrKeep(condition: (StateSiteType) => Boolean)(f: (StateSiteType) => A)(implicit ev: StateSiteType<:<A): Seq[A] = {
stateSites.map {
site => if (condition(site)) f(site) else site
}
}
val reactantSiteToIntersect:Option[ReactantStateSite] = otherMonomer.stateSites.find(_.name == thisSite.name)
reactantSiteToIntersect.map {
siteToReplace =>
val newSites = replaceOrKeep {_ == thisSite } { item => thisSite.createIntersection( ev(item) ) }
MonomerClass(newSites)
}
}
}
object MonomerClass {
def apply[A <: StateSite](sites:Seq[A]):MonomerClass[A] = new MonomerClass[A] {
val stateSites = sites
}
}
object Monomers{
type Monomer = MonomerClass[StateSite]
type ReactantMonomer = MonomerClass[ReactantStateSite]
type ProductMonomer = MonomerClass[ProductStateSite]
type ProducedMonomer = MonomerClass[ProducedStateSite]
}
-
Обратите внимание, что этот шаблон можно использовать без специального импорта, если вы используете умные способы неявного разрешения правил (например, вы помещаете свой insector в объект-компаньон из свойства Intersector, чтобы он автоматически разрешался).
-
Хотя этот шаблон работает отлично, существует ограничение, связанное с тем, что ваше решение работает только для определенного типа StateSiteType. Коллекции Scala разрешают аналогичную проблему, добавляя еще один неявный, который вызывает CanBuildFrom. В нашем случае мы будем называть его CanReact
Вам нужно будет сделать свой инвариант MonomerClass, который может быть проблемой (зачем вам нужна ковариация?)
trait CanReact[A, B] {
implicit val intersector: Intersector[B]
def react(a: A, b: B): B
def reactFunction(b:B) : A=>B = react(_:A,b)
}
object CanReact {
implicit def CanReactWithReactantSite[A<:ReactantStateSite](implicit inters: Intersector[A]): CanReact[ReactantStateSite,A] = {
new CanReact[ReactantStateSite,A] {
val intersector = inters
def react(a: ReactantStateSite, b: A) = a.createIntersection(b)
}
}
}
trait MonomerClass[StateSiteType <: StateSite] {
val stateSites: Seq[StateSiteType]
def replaceSiteWithIntersection[A >: StateSiteType <: ReactantStateSite](thisSite: A, otherMonomer: ReactantMonomer)(implicit canReact:CanReact[StateSiteType,A]): Option[MonomerClass[A]] = {
def replaceOrKeep(condition: (StateSiteType) => Boolean)(f: (StateSiteType) => A)(implicit ev: StateSiteType<:<A): Seq[A] = {
stateSites.map {
site => if (condition(site)) f(site) else site
}
}
val reactantSiteToIntersect:Option[ReactantStateSite] = otherMonomer.stateSites.find(_.name == thisSite.name)
reactantSiteToIntersect.map {
siteToReplace =>
val newSites = replaceOrKeep {_ == thisSite } { canReact.reactFunction(thisSite)}
MonomerClass(newSites)
}
}
}
При такой реализации всякий раз, когда вы захотите заменить сайт другим сайтом другого типа, вам нужно только открыть новые неявные экземпляры CanReact с разными типами.
В заключение я (я надеюсь) объясню, почему вам не нужна ковариация.
Скажем, у вас есть Consumer[T]
и Producer[T]
.
Вам нужна ковариация, если вы хотите предоставить Consumer[T1]
a Producer[T2]
, где T2<:<T1
. Но если вам нужно использовать значение, созданное T2 внутри T1, вы можете
class ConsumerOfStuff[T <: CanBeContained] {
def doWith(stuff: Stuff[T]) = stuff.t.writeSomething
}
trait CanBeContained {
def writeSomething: Unit
}
class A extends CanBeContained {
def writeSomething = println("hello")
}
class B extends A {
override def writeSomething = println("goodbye")
}
class Stuff[T <: CanBeContained](val t: T)
object VarianceTest {
val stuff1 = new Stuff(new A)
val stuff2 = new Stuff(new B)
val consumerOfStuff = new ConsumerOfStuff[A]
consumerOfStuff.doWith(stuff2)
}
Этот материал явно не компилируется:
ошибка: тип несоответствия; найдено: Материал [B] требуется: Материал [A] Примечание: B <: A, но класс Stuff инвариантен по типу T. Вы можете определить T как + T. (SLS 4.5) consumerOfStuff.doWith(stuff2).
Но опять же это происходит из-за неверного истолкования использования дисперсии, поскольку Как координируется и противоречиво используется при проектировании бизнес-приложений? Крис Нуттыкомб ответ объясняет. Если мы реорганизуем следующий
class ConsumerOfStuff[T <: CanBeContained] {
def doWith[A<:T](stuff: Stuff[A]) = stuff.t.writeSomething
}
Вы можете видеть, что все компилируется отлично.
Ответ 2
Не ответ, но что я могу наблюдать из вопроса:
- Я вижу
MonomerClass
, но не Monomer
Мои мужества говорят, что вам следует избегать проявлений, когда это возможно, поскольку вы видели, что они могут усложнить ситуацию. Я не думаю, что они вам понадобятся. Например, метод justTheProductMonomers
в GraphClass
– так как у вас есть полный контроль над иерархией классов, почему бы не добавить методы тестирования для чего-либо, связанного с проверкой времени выполнения, на Monomer
напрямую? Например.
trait Monomer {
def productOption: Option[ProductMonomer]
}
тогда у вас будет
def justTheProductMonomers : Seq[ProductMonomer] = monomers.flatMap( _.productOption )
и т.д.
Проблема заключается в том, что кажется, что у вас может быть общий мономер, удовлетворяющий предикату продукта, тогда как вы каким-то образом захотите подтипа ProductMonomer
.
Общая рекомендация, которую я бы дал, - это сначала определить вашу матрицу тестов, которая вам нужна для обработки правил, а затем поместить эти тесты в качестве методов в конкретные черты, если у вас нет плоской иерархии, для которой вы можете выполнить сопоставление шаблонов, что проще, так как неоднозначность окажется сосредоточенной на вашем сайте использования и не распространяется на все типы реализации.
Также не пытайтесь просрочить его с помощью ограничений типа компиляции. Часто это прекрасно, чтобы некоторые ограничения проверялись во время выполнения. Таким образом, по крайней мере, вы можете создать полностью работоспособную систему, а затем можете попытаться определить точки, в которых вы можете конвертировать проверку времени выполнения в проверку времени компиляции, и решить, стоит ли это или нет. Это привлекательно, чтобы решить вещи на уровне типа в Scala, из-за его сложности, но для этого также требуется большинство навыков, чтобы сделать это правильно.
Ответ 3
Существует несколько проблем. Во-первых, весь метод является странным: с одной стороны, вы передаете аргумент monomer
, и если найден аргумент thisState
, этот метод не имеет ничего общего с приемником &mdash, то почему это метод в MonomerClass
вообще, а не "свободно плавающая" функция —, с другой стороны, вы возвращаетесь к возврату this
, если thisSite
не найден. Поскольку вы изначально имели также implicit evidence: MyType <:< ReactantMonomer
, я предполагаю, что весь аргумент monomer
устарел, и вы действительно хотели работать с new_this
.
Немного очистки, забывая о манифестах на данный момент, вы могли бы
case class MonomerClass[+StateSiteType <: StateSite, +EdgeSiteType <: EdgeSite](
stateSites: Seq[StateSiteType], edgeSites: Seq[EdgeSiteType]) {
def replaceSiteWithIntersection[A <: ReactantStateSite { type MyType = A }]
(thisSite: A)(implicit ev: this.type <:< MonomerClass[A, ReactantEdgeSite])
: MonomerClass[A, ReactantEdgeSite] = {
val monomer = ev(this)
monomer.stateSites.find(_.name == thisSite.name) match {
case Some(otherSite) =>
val newSites = monomer.stateSites map {
case `thisSite` => thisSite.createIntersection(otherSite)
case other => other
}
monomer.copy(stateSites = newSites)
case None => monomer
}
}
}
Это была интересная проблема, мне потребовались несколько итераций, чтобы избавиться от (неправильного!) кастинга. Теперь это на самом деле вполне читаемо: этот метод ограничивается доказательством того, что StateSiteType
на самом деле является подтипом A
of ReactantStateSite
. Поэтому параметр типа A <: ReactantStateSite { type MyType = A }
— последний бит интересен, и это была новая находка для меня: здесь вы можете указать член типа, чтобы убедиться, что ваш тип возврата из createIntersection
на самом деле A
.
В вашем методе все еще есть что-то странное, потому что, если я не ошибаюсь, вы в конечном итоге вызываете x.createIntersection(x)
(пересекая thisSite
с собой, что является не-оператором).
Ответ 4
Одна из недостатков replaceSiteWithIntersection
заключается в том, что согласно сигнатуре метода тип thisSite
(A
) является супер-типом StateSiteType
тип ReactantStateSite
.
Но затем вы в конце концов отбросите его на StateSiteType with ReactantStateSite
. Это не имеет смысла для меня.
Где вы получаете уверенность в том, что A
внезапно является StateSiteType
?