Туки пять резюме резюме в Python

Мне не удалось найти эту функцию в любом из стандартных пакетов, поэтому я написал одно из них. Однако, прежде чем бросать его в Cheeseshop, кто-нибудь знает о уже опубликованной версии? В качестве альтернативы, пожалуйста, предложите любые улучшения. Благодарю.

def fivenum(v):
    """Returns Tukey five number summary (minimum, lower-hinge, median, upper-hinge, maximum) for the input vector, a list or array of numbers based on 1.5 times the interquartile distance"""
    import numpy as np
    from scipy.stats import scoreatpercentile
    try:
        np.sum(v)
    except TypeError:
        print('Error: you must provide a list or array of only numbers')
    q1 = scoreatpercentile(v,25)
    q3 = scoreatpercentile(v,75)
    iqd = q3-q1
    md = np.median(v)
    whisker = 1.5*iqd
    return np.min(v), md-whisker, md, md+whisker, np.max(v),

Ответы

Ответ 1

pandas Series и DataFrame имеют метод describe, который похож на R summary:

In [3]: import numpy as np

In [4]: import pandas as pd

In [5]: s = pd.Series(np.random.rand(100))

In [6]: s.describe()
Out[6]: 
count    100.000000
mean       0.540376
std        0.296250
min        0.002514
25%        0.268722
50%        0.593436
75%        0.831067
max        0.991971

NAN обрабатываются правильно.

Ответ 2

Я бы избавился от этих двух вещей:

import numpy as np
from scipy.stats import scoreatpercentile

Вы должны импортировать на уровне модуля. Это означает, что пользователи будут знать о недостающих зависимостях, как только они импортируют ваш модуль, а не при вызове функции.

try:
    sum(v)
except TypeError:
    print('Error: you must provide a list or array of only numbers')

Несколько проблем с этим:

  • Не вводите проверку в Python. Документ, который выполняет функция.
  • Как вы узнаете, что вызывающие абоненты увидят это? Они могут не работать на консоли, и даже если они есть, они могут не захотеть, чтобы ваше сообщение об ошибке мешало их выводу.
  • Не вводите проверку в Python.

Если вы хотите поднять какое-либо исключение для недействительных данных (проверка не), либо разрешить распространение существующего исключения, либо обернуть его в свое собственное исключение тип.

Ответ 3

Если кому-то понадобится версия, которая работает с NaN в данных, вот моя модификация. Я не хотел менять исходный ответ на плакат, чтобы избежать путаницы.

import numpy as np
from scipy.stats import scoreatpercentile
from scipy.stats import nanmedian

def fivenum(v):
    """Returns Tukey five number summary (minimum, lower-hinge, median, upper-hinge, maximum) for the input vector, a list or array of numbers based on 1.5 times the interquartile distance"""
    try:
        np.sum(v)
    except TypeError:
        print('Error: you must provide a list or array of only numbers')
    q1 = scoreatpercentile(v[~np.isnan(v)],25)
    q3 = scoreatpercentile(v[~np.isnan(v)],75)
    iqd = q3-q1
    md = nanmedian(v)
    whisker = 1.5*iqd
    return np.nanmin(v), md-whisker, md, md+whisker, np.nanmax(v),

Ответ 4

Я новичок в Python, но результат вычисляется неверно: он должен быть max (min (v), q1-whisker) для нижней границы и min (max (v), q3 + whisker) для верхней границы, Это как в R (функция summary()), и то, что отображается на ящиках в matplotlib.pyplot и в R.

Ответ 5

Попробуйте следующее:

import numpy as np
import numpy.random
from statstools import run
from scipy.stats import scoreatpercentile

data=np.random.randn(5)

return (min(data), md-whisker, md, md+whisker, max(data))

Ответ 6

Минимально, но он выполняет свою работу.:)

import numpy as np
[round(np.percentile(results[:,4], i), 1) for i in [1, 2, 5, 10, 25, 50]]