Ответ 1
Вам нужно включить режим без конфликтов в jQuery, см.
http://docs.jquery.com/Using_jQuery_with_Other_Libraries
Из приведенной выше ссылки:
<html>
<head>
<script src="prototype.js"></script>
<script src="jquery.js"></script>
<script>
jQuery.noConflict();
// Use jQuery via jQuery(...)
jQuery(document).ready(function(){
jQuery("div").hide();
});
// Use Prototype with $(...), etc.
$('someid').hide();
</script>
</head>
<body></body>
</html>
Однако вам все равно придется загружать Prototype для Scriptaculous для работы. В качестве предложения вы можете попробовать jQuery autocomplete plugin, если вы используете эти другие библиотеки только (или в основном) для виджета автозаполнения.