Как я могу получить возвращаемое значение с помощью модуля Python Timeit?
Я запускаю несколько алгоритмов машинного обучения со sklearn в цикле for и хочу посмотреть, сколько времени займет каждый из них. Проблема в том, что мне также нужно возвращать значение, и НЕ нужно запускать его более одного раза, потому что каждый алгоритм занимает так много времени. Есть ли способ получить возвращаемое значение 'clf' с помощью модуля Python Timeit или аналогичного с такой функцией...
def RandomForest(train_input, train_output):
clf = ensemble.RandomForestClassifier(n_estimators=10)
clf.fit(train_input, train_output)
return clf
когда я вызываю такую функцию
t = Timer(lambda : RandomForest(trainX,trainy))
print t.timeit(number=1)
P.S. Я также не хочу устанавливать глобальный "clf", потому что я мог бы хотеть сделать многопоточность или многопроцессорность позже.
Ответы
Ответ 1
Проблема сводится к тому, что timeit._template_func не возвращает возвращаемое значение функции:
def _template_func(setup, func):
"""Create a timer function. Used if the "statement" is a callable."""
def inner(_it, _timer, _func=func):
setup()
_t0 = _timer()
for _i in _it:
_func()
_t1 = _timer()
return _t1 - _t0
return inner
Мы можем согнуть timeit
к нашей воле с помощью небольшого количества исправлений:
import timeit
import time
def _template_func(setup, func):
"""Create a timer function. Used if the "statement" is a callable."""
def inner(_it, _timer, _func=func):
setup()
_t0 = _timer()
for _i in _it:
retval = _func()
_t1 = _timer()
return _t1 - _t0, retval
return inner
timeit._template_func = _template_func
def foo():
time.sleep(1)
return 42
t = timeit.Timer(foo)
print(t.timeit(number=1))
возвращает
(1.0010340213775635, 42)
Первое значение - результат timeit (в секундах), второе значение - возвращаемое значение функции.
Обратите внимание, что вышеприведенный патч обезьяны влияет только на поведение timeit
, когда передан вызываемый вызов timeit.Timer
. Если вы передадите строковый оператор, то вам придется (аналогичным образом) обезьянько-патчить строку timeit.template
.
Ответ 2
Как ни странно, я также занимаюсь машинным обучением и имею аналогичные требования ;-)
Я решил это следующим образом, написав функцию, которая:
- выполняет вашу функцию
- печатает время выполнения вместе с названием вашей функции
- возвращает результаты
Допустим, вы хотите время:
clf = RandomForest(train_input, train_output)
Затем выполните:
clf = time_fn( RandomForest, train_input, train_output )
Stdout покажет что-то вроде:
mymodule.RandomForest: 0.421609s
Код для time_fn:
import time
def time_fn( fn, *args, **kwargs ):
start = time.clock()
results = fn( *args, **kwargs )
end = time.clock()
fn_name = fn.__module__ + "." + fn.__name__
print fn_name + ": " + str(end-start) + "s"
return results
Ответ 3
Для Python 3.5 вы можете переопределить значение timeit.template
timeit.template = """
def inner(_it, _timer{init}):
{setup}
_t0 = _timer()
for _i in _it:
retval = {stmt}
_t1 = _timer()
return _t1 - _t0, retval
"""
unutbu answer работает для python 3.4, но не 3.5, так как функция _template_func, кажется, была удалена в 3.5
Ответ 4
Если я хорошо понимаю, после Python 3.5 вы можете определять глобалы в каждом экземпляре Timer, не определяя их в своем блоке кода. Я не уверен, что у него будут те же проблемы с распараллеливанием.
Мой подход будет примерно таким:
clf = ensemble.RandomForestClassifier(n_estimators=10)
myGlobals = globals()
myGlobals.update({'clf'=clf})
t = Timer(stmt='clf.fit(trainX,trainy)', globals=myGlobals)
print(t.timeit(number=1))
print(clf)
Ответ 5
Подход, который я использую, заключается в "добавлении" времени выполнения к результатам функции timed. Итак, я пишу очень простой декоратор, используя модуль "время":
def timed(func):
def func_wrapper(*args, **kwargs):
import time
s = time.clock()
result = func(*args, **kwargs)
e = time.clock()
return result + (e-s,)
return func_wrapper
А потом я использую декоратор для функции, которую я хочу, чтобы время.
Ответ 6
Для Python 3.X я использую этот подход:
# Redefining default Timer template to make 'timeit' return
# test execution timing and the function return value
new_template = """
def inner(_it, _timer{init}):
{setup}
_t0 = _timer()
for _i in _it:
ret_val = {stmt}
_t1 = _timer()
return _t1 - _t0, ret_val
"""
timeit.template = new_template