Sklearn selectKbest: какие переменные были выбраны?
Я пытаюсь получить sklearn для выбора лучших k переменных (например, k = 1) для линейной регрессии. Это работает, и я могу получить R-квадрат, но он не говорит мне, какие переменные были лучшими. Как я могу это узнать?
У меня есть код следующей формы (список реальных переменных намного длиннее):
X=[]
for i in range(len(df)):
X.append([averageindegree[i],indeg3_sum[i],indeg5_sum[i],indeg10_sum[i])
training=[]
actual=[]
counter=0
for fold in range(500):
X_train, X_test, y_train, y_test = crossval.train_test_split(X, y, test_size=0.3)
clf = LinearRegression()
#clf = RidgeCV()
#clf = LogisticRegression()
#clf=ElasticNetCV()
b = fs.SelectKBest(fs.f_regression, k=1) #k is number of features.
b.fit(X_train, y_train)
#print b.get_params
X_train = X_train[:, b.get_support()]
X_test = X_test[:, b.get_support()]
clf.fit(X_train,y_train)
sc = clf.score(X_train, y_train)
training.append(sc)
#print "The training R-Squared for fold " + str(1) + " is " + str(round(sc*100,1))+"%"
sc = clf.score(X_test, y_test)
actual.append(sc)
#print "The actual R-Squared for fold " + str(1) + " is " + str(round(sc*100,1))+"%"
Ответы
Ответ 1
Попробуйте использовать b.fit_transform()
вместо b.tranform()
. fit_transform()
с подгонкой и преобразовать ваш вход X в новый X с выбранными функциями и вернуть новый X.
...
b = fs.SelectKBest(fs.f_regression, k=1) #k is number of features.
X_train = b.fit_transform(X_train, y_train)
#print b.get_params
...
Ответ 2
Вам нужно использовать get_support:
features_columns = [.......]
fs = SelectKBest(score_func=f_regression, k=5)
print zip(fs.get_support(),features_columns)
Ответ 3
Способ сделать это - настроить SelectKBest с вашей любимой функцией (регрессия в вашем случае), а затем получить из нее параметры.
Мой код предполагает, что у вас есть список features_list
, который содержит имена всех заголовков X.
kb = SelectKBest(score_func=f_regression, k=5) # configure SelectKBest
kb.fit(X, Y) # fit it to your data
# get_support gives a vector [False, False, True, False....]
print(features_list[kb.get_support()])
Конечно, вы можете написать больше pythonic, чем я: -)