Ответ 1
AStyle можно настроить очень подробно для С++ и Java (и других)
Это инструмент форматирования исходного кода.
clang-format - это мощный инструмент командной строки, связанный с компилятором clang, который обрабатывает даже самые неясные языковые конструкции согласованным образом.
Он может быть интегрирован с Visual Studio, Emacs, Vim (и другими) и может форматировать только выбранные строки (или с помощью git/svn для форматирования некоторого diff).
Его можно настроить с помощью следующих опций здесь.
При использовании конфигурационных файлов (с именем .clang-format) стили могут быть для каждого каталога - ближайший такой файл в родительских каталогах должен использоваться для определенного файла.
Стили могут быть унаследованы от пресета (например, LLVM или Google) и могут позже переопределять различные параметры
Он используется Google и другими и готовится к производству.
Также посмотрите на проект UniversalIndentGUI. Вы можете поэкспериментировать с несколькими indenters, используя его: AStyle, Uncrustify, GreatCode,... и выберите лучшее для вас. Любой из них можно запустить позже из командной строки.
Uncrustify имеет множество настраиваемых параметров. Вам, вероятно, понадобится универсальный GUI отступов (в ответе Константина), чтобы настроить его.