Do.call в сочетании с "::"
Я использую "do.call" для генерации вызовов функций. Например:
myfun <- "rnorm";
myargs <- list(n=10, mean=5);
do.call(myfun, myargs);
Однако иногда я хотел бы явно вызвать функцию из определенного пакета. Аналогично, например, stats::rnorm(n=10, mean=5)
. Есть ли способ, которым я могу использовать do.call, или создать функцию, которая ведет себя так же, как do.call, чтобы заставить это работать:
myfun <- "stats::rnorm";
myargs <- list(n=10, mean=5);
do.call(myfun, myargs);
Ответы
Ответ 1
Нет функции, называемой "stats:: rnorm". Вы должны найти функцию rnorm
в пространстве имен "stats":
myfun <- get("rnorm", asNamespace("stats"))
myargs <- list(n=10, mean=5);
do.call(myfun, myargs);
Теперь вы можете, конечно, также перейти от имени типа "stats:: rnorm" и разделить его на часть пространства имен и имя функции:
funname <- "stats::rnorm"
fn <- strsplit(funname, "::")[[1]]
myfun <- if (length(fn)==1) fn[[1]] else get(fn[[2]], asNamespace(fn[[1]]))
myargs <- list(n=10, mean=5);
do.call(myfun, myargs);
Обновление Я просто хотел показать, что этот подход в 2,5 раза быстрее, чем тот, который из @Jeroen...
do.call.tommy <- function(what, args, ...) {
if(is.character(what)){
fn <- strsplit(what, "::")[[1]]
what <- if(length(fn)==1) {
get(fn[[1]], envir=parent.frame(), mode="function")
} else {
get(fn[[2]], envir=asNamespace(fn[[1]]), mode="function")
}
}
do.call(what, as.list(args), ...)
}
# Test it
do.call.tommy(runif, 10)
f1 <- function(FUN) do.call.tommy(FUN, list(5))
f2 <- function() { myfun<-function(x) x; do.call.tommy(myfun, list(5)) }
f1(runif)
f1("stats::runif")
f2()
# Test the performance...
system.time(for(i in 1:1e4) do.call.jeroen("stats::runif", list(n=1, max=50))) # 1.07 secs
system.time(for(i in 1:1e4) do.call.tommy("stats::runif", list(n=1, max=50))) # 0.42 secs
Ответ 2
Вы можете удалить кавычки: это будет сама функция, а не ее имя.
myfun <- stats::rnorm
myargs <- list(n=10, mean=5)
do.call(myfun, myargs)
Ответ 3
Спасибо за ответы. Я думаю, что я собираюсь сделать что-то вроде этого:
do.call.jeroen <- function(what, args, ...){
if(is.function(what)){
what <- deparse(as.list(match.call())$what);
}
myfuncall <- parse(text=what)[[1]];
mycall <- as.call(c(list(myfuncall), args));
eval(mycall, ...);
}
Это кажется хорошим обобщением do.call
, поэтому я могу передать символьную строку для аргумента what
, но он аккуратно эмулирует вызов stats::rnorm(n=10, mean=5)
.
myfun1 <- "rnorm";
myfun2 <- "stats::rnorm";
myargs <- list(n=10, mean=5);
do.call.jeroen(myfun1, myargs);
do.call.jeroen(myfun2, myargs);
do.call.jeroen(rnorm, myargs);
do.call.jeroen(stats::rnorm, myargs);
Хорошо, что если функция, которую я вызываю, использует match.call() для хранения вызова где-то, она сохранит фактическое имя функции. Например:
do.call.jeroen( "stats:: glm", list (formula = speed ~ dist, data = as.name('cars')))
Call: stats::glm(formula = speed ~ dist, data = cars)
Coefficients:
(Intercept) dist
8.2839 0.1656
Degrees of Freedom: 49 Total (i.e. Null); 48 Residual
Null Deviance: 1370
Residual Deviance: 478 AIC: 260.8