Определите линейную функцию на растровой карте и верните объект линейной формы, используя R
Я хотел бы идентифицировать линейные особенности, такие как дороги и реки, на растровых картах и преобразовать их в линейный пространственный объект (класс SpatialLines
), используя R.
Пакеты raster
и sp
могут использоваться для преобразования объектов из растров в векторные объекты многоугольника (класс SpatialPolygons
). rasterToPolygons()
будет извлекать ячейки определенного значения из растра и возвращать объект многоугольника. Продукт можно упростить, используя параметр dissolve=TRUE
, который вызывает процедуры в пакете rgeos
для этого.
Все это работает отлично, но я бы предпочел, чтобы это был объект SpatialLines
. Как я могу это сделать?
Рассмотрим следующий пример:
## Produce a sinuous linear feature on a raster as an example
library(raster)
r <- raster(nrow=400, ncol=400, xmn=0, ymn=0, xmx=400, ymx=400)
r[] <- NA
x <-seq(1, 100, by=0.01)
r[cellFromRowCol(r, round((sin(0.2*x) + cos(0.06*x)+2)*100), round(x*4))] <- 1
## Quick trick to make it three cells wide
r[edge(r, type="outer")] <- 1
## Plot
plot(r, legend=FALSE, axes=FALSE)
![Raster representation of linear feature as an example]()
## Convert linear feature to a SpatialPolygons object
library(rgeos)
rPoly <- rasterToPolygons(r, fun=function(x) x==1, dissolve=TRUE)
plot(rPoly)
![SpatialPolygons representation of the linear feature]()
Лучше ли было бы найти осевую линию через многоугольник?
Или существует ли доступный код для этого?
EDIT: Благодаря @mdsumner для указания, что это называется скелетонизацией.
Ответы
Ответ 1
Вот мои усилия. План:
- уплотнение строк
- вычислить триангуляцию delaunay
- возьмите средние точки и возьмите те точки, которые находятся в многоугольнике
- построить минимально-взвешенное минимальное остовное дерево.
- найти его путь диаметра графика
Уплотнительный код для стартеров:
densify <- function(xy,n=5){
## densify a 2-col matrix
cbind(dens(xy[,1],n=n),dens(xy[,2],n=n))
}
dens <- function(x,n=5){
## densify a vector
out = rep(NA,1+(length(x)-1)*(n+1))
ss = seq(1,length(out),by=(n+1))
out[ss]=x
for(s in 1:(length(x)-1)){
out[(1+ss[s]):(ss[s+1]-1)]=seq(x[s],x[s+1],len=(n+2))[-c(1,n+2)]
}
out
}
И теперь основное блюдо:
simplecentre <- function(xyP,dense){
require(deldir)
require(splancs)
require(igraph)
require(rgeos)
### optionally add extra points
if(!missing(dense)){
xy = densify(xyP,dense)
} else {
xy = xyP
}
### compute triangulation
d=deldir(xy[,1],xy[,2])
### find midpoints of triangle sides
mids=cbind((d$delsgs[,'x1']+d$delsgs[,'x2'])/2,
(d$delsgs[,'y1']+d$delsgs[,'y2'])/2)
### get points that are inside the polygon
sr = SpatialPolygons(list(Polygons(list(Polygon(xyP)),ID=1)))
ins = over(SpatialPoints(mids),sr)
### select the points
pts = mids[!is.na(ins),]
dPoly = gDistance(as(sr,"SpatialLines"),SpatialPoints(pts),byid=TRUE)
pts = pts[dPoly > max(dPoly/1.5),]
### now build a minimum spanning tree weighted on the distance
G = graph.adjacency(as.matrix(dist(pts)),weighted=TRUE,mode="upper")
T = minimum.spanning.tree(G,weighted=TRUE)
### get a diameter
path = get.diameter(T)
if(length(path)!=vcount(T)){
stop("Path not linear - try increasing dens parameter")
}
### path should be the sequence of points in order
list(pts=pts[path+1,],tree=T)
}
Вместо буферизации более ранней версии я вычисляю расстояние от каждой середины до линии многоугольника и беру только точки, которые являются а) внутри, и б) дальше от края, чем 1,5 от расстояния внутри точка, которая наиболее удалена от края.
Проблемы могут возникнуть, если многоугольник откидывается на себя, с длинными сегментами и без уплотнения. В этом случае граф является деревом, и код сообщает об этом.
В качестве теста я оцифровал строку (s, объект SpatialLines), забуферировал ее (p), затем вычислил осевую линию и наложил ее:
s = capture()
p = gBuffer(s,width=0.2)
plot(p,col="#cdeaff")
plot(s,add=TRUE,lwd=3,col="red")
scp = simplecentre(onering(p))
lines(scp$pts,col="white")
![source line (red), polygon (blue) and recovered centreline (white)]()
Функция "onering" просто получает координаты одного кольца из объекта SpatialPolygons, который должен быть только одним кольцом:
onering=function(p){[email protected][[1]]@Polygons[[1]]@coords}
Захват пространственных линий с функцией "захвата":
capture = function(){p=locator(type="l")
SpatialLines(list(Lines(list(Line(cbind(p$x,p$y))),ID=1)))}
Ответ 2
Вы можете получить границу этого многоугольника как SpatialLines прямым принуждением:
rLines <- as(rPoly, "SpatialLinesDataFrame")
Подведение итогов координат до одной "центральной линии" было бы возможно, но ничего непосредственного, о котором я не знаю. Я думаю, что этот процесс обычно называют "скелетонизацией":
http://en.wikipedia.org/wiki/Topological_skeleton
Ответ 3
Благодаря @klewis на gis.stackexchange.com для ссылки на этот элегантный алгоритм для нахождения центральной линии (в ответ на соответствующий вопрос, который я задал там).
Процесс требует нахождения координат на краю многоугольника, описывающего линейную особенность, и выполнения тероселяции Вороного этих точек. Координаты плиток Вороного, которые попадают в многоугольник линейной функции, попадают на осевую линию. Поверните эти точки в строку.
Теоретизация Вороного выполняется эффективно в R с использованием пакета deldir
и пересечений многоугольников и точек с пакетом rgeos
.
## Find points on boundary of rPoly (see question)
rPolyPts <- coordinates(as(as(rPoly, "SpatialLinesDataFrame"),
"SpatialPointsDataFrame"))
## Perform Voronoi tessellation of those points and extract coordinates of tiles
library(deldir)
rVoronoi <- tile.list(deldir(rPolyPts[, 1], rPolyPts[,2]))
rVoronoiPts <- SpatialPoints(do.call(rbind,
lapply(rVoronoi, function(x) cbind(x$x, x$y))))
## Find the points on the Voronoi tiles that fall inside
## the linear feature polygon
## N.B. That the width parameter may need to be adjusted if coordinate
## system is fractional (i.e. if longlat), but must be negative, and less
## than the dimension of a cell on the original raster.
library(rgeos)
rLinePts <- gIntersection(gBuffer(rPoly, width=-1), rVoronoiPts)
## Create SpatialLines object
rLine <- SpatialLines(list(Lines(Line(rLinePts), ID="1")))
Получаемый объект SpatialLines:
![SpatialLines object describing linear feature from a raster]()
Ответ 4
Я думаю, что идеальным решением было бы создать такой отрицательный буфер, который динамически достигает минимальной ширины и не ломается, когда значение слишком велико; сохраняет продолжение объекта и в конечном итоге рисует линию, если значение достигнуто. Но, к сожалению, это может быть очень требовательным к вычислениям, потому что это будет сделано, вероятно, поэтапно и проверяет, достаточно ли значения для конкретной точки, чтобы иметь точку (нашей средней линии). Возможно, ему не нужно иметь бесконечное число шагов или, по крайней мере, какое-то параметризованное значение.
Я не знаю, как реализовать это сейчас.