Отображать график без сохранения с помощью pydot

Я пытаюсь отобразить простой граф, используя pydot.

Мой вопрос в том, что есть какой-либо способ отобразить график, не записывая его в файл, поскольку в настоящее время я использую функцию записи для первого рисования, а затем должен использовать модуль Image для отображения файлов.

Однако есть ли какой-либо способ, чтобы график непосредственно печатался на экране без сохранения??

Также как обновление, я хотел бы задать в этом же вопросе, что я заметил, что, хотя изображение быстро сохраняется, когда я использую команду show модуля Image, требуется время, чтобы изображение было видно... Также иногда я получаю ошибку, что изображение не может быть открыто, потому что оно было либо удалено, либо сохранено в недоступном месте, что неверно, поскольку я сохраняю его на своем рабочем столе..... Кто-нибудь знает, что происходит и есть более быстрый способ загрузки изображения.....

Большое спасибо....

Ответы

Ответ 1

Я боюсь, что pydot использует graphviz для рендеринга графиков. I.e., он запускает исполняемый файл и загружает полученное изображение.

Нижняя строка - нет, вы не можете избежать создания файла.

Ответ 2

Вы можете визуализировать изображение из pydot, вызвав GraphViz dot не записывая никаких файлов на диск. Тогда просто подготовьте это. Это можно сделать следующим образом, предполагая, что g - это pydot граф:

from cStringIO import StringIO

import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.image as mpimg
import networkx as nx

# create a networkx graph
G = nx.MultiDiGraph()
G.add_nodes_from([1,2] )
G.add_edge(1, 2)

# convert from networkx -> pydot
pydot_graph = G.to_pydot()

# render pydot by calling dot, no file saved to disk
png_str = pydot_graph.create_png(prog='dot')

# treat the dot output string as an image file
sio = StringIO()
sio.write(png_str)
sio.seek(0)
img = mpimg.imread(sio)

# plot the image
imgplot = plt.imshow(img, aspect='equal')
plt.show(block=False)

Это особенно полезно для ориентированных графов, поскольку matplotlib возможность networkx будет сильно ограничена для таких графиков.

Смотрите также этот запрос на извлечение, который вводит такие возможности непосредственно в networkx. Осталось написать интерфейс для загрузки и построения макета, сгенерированного GraphViz как GraphViz для MATLAB в интерфейсе обмена файлами GraphViz, MATLAB GraphViz Layout, GraphViz4Matlab.

Ответ 3

Вот простое решение с использованием IPython:

from IPython.display import Image, display

def view_pydot(pdot):
    plt = Image(pdot.create_png())
    display(plt)

Пример использования:

import networkx as nx
to_pdot = nx.drawing.nx_pydot.to_pydot
pdot = to_pdot(nx.complete_graph(5))
view_pydot(pdot)

Ответ 4

Основываясь на этом ответе (как показать изображения на python), здесь несколько строк:

gr = ... <pydot.Dot instance> ...

import tempfile, Image
fout = tempfile.NamedTemporaryFile(suffix=".png")
gr.write(fout.name,format="png")
Image.open(fout.name).show()

Image находится в Python Imaging Library