Ответ 1
Посмотрите на автоматически созданный проект "Серверы". Должна быть папка для каждого настроенного сервера. Там откройте context.xml и добавьте все, что вам нравится, в контекст "по умолчанию" (например, "Параметры-теги" ).
Все, что внутри будет использоваться для заполнения контекста. xml WTP автоматически создает при публикации для каждого проекта на этом сервере.
Или используйте специфический для проекта способ: поместите context.xml со своим содержимым внутри META-INF в свой проект (смотрите здесь: http://wiki.eclipse.org/WTP_Tomcat_FAQ#How_do_I_specify_the_Tomcat_context_configuration_for_my_Web_Application.3F)