Devtools:: install_github не работает с ошибкой CA cert
Когда я пытаюсь вызвать install_github, я получаю следующую ошибку (не только для этого пакета, но и для всех пакетов github):
> install_github('ramnathv/slidify')
Downloading github repo ramnathv/[email protected]
Error in curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) :
Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
Но если я напрямую использую RCURL для доступа к github с ssl, я не получаю никаких проблем:
> x <- getBinaryURL(
url='https://github.com/ramnathv/slidify/archive/master.zip',
followlocation=1L
)
работает без ошибок, поэтому RCURL может корректно проверить сертификат SSL и загрузить файл архива.
> sessionInfo()
R version 3.2.1 (2015-06-18)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Debian GNU/Linux 8 (jessie)
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.utf8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.utf8 LC_COLLATE=en_US.utf8
[5] LC_MONETARY=en_US.utf8 LC_MESSAGES=en_US.utf8
[7] LC_PAPER=en_US.utf8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.utf8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] RCurl_1.95-4.7 bitops_1.0-6 devtools_1.8.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] httr_1.0.0 R6_2.1.0 magrittr_1.5 rversions_1.0.2
[5] tools_3.2.1 curl_0.9.1 Rcpp_0.12.0 memoise_0.2.1
[9] xml2_0.1.1 stringi_0.5-5 git2r_0.10.1 stringr_1.0.0
[13] digest_0.6.8
и
> curlVersion()
$age
[1] 3
$version
[1] "7.38.0"
$vesion_num
[1] 468480
$host
[1] "x86_64-pc-linux-gnu"
$features
ipv6 ssl libz ntlm asynchdns spnego
1 4 8 16 128 256
largefile idn tlsauth_srp ntlm_wb
512 1024 16384 32768
$ssl_version
[1] "OpenSSL/1.0.1k"
$ssl_version_num
[1] 0
$libz_version
[1] "1.2.8"
$protocols
[1] "dict" "file" "ftp" "ftps" "gopher" "http" "https" "imap"
[9] "imaps" "ldap" "ldaps" "pop3" "pop3s" "rtmp" "rtsp" "scp"
[17] "sftp" "smtp" "smtps" "telnet" "tftp"
$ares
[1] ""
$ares_num
[1] 0
$libidn
[1] "1.29"
Если я использую httr::set_config( httr::config( ssl_verifypeer = 0L ) ), тогда я могу успешно запустить install_github, но я бы предпочел проверить сертификаты ssl.
Может ли кто-нибудь предложить решение?
Ответы
Ответ 1
Наконец понял это.
У меня было две разные библиотеки ssl, и по какой-то причине пакет RCurl был создан против libcurl4-openssl-dev и пакета curl, созданного против libcurl4-nss-dev, но я только установил ключи CA для openssl, а не для nss.
Я решил свою проблему с remove.packages('curl') в R, а затем вышел из R и из оболочки apt-get remove libcurl4-nss-dev, начиная с R и install.packages('curl')
Моя ошибка, которая привела к моему вопросу, заключалась в проверке обработки SSL CA с использованием RCurl вместо httr или curl, что быстро привело бы меня к тому, что мой пакет curl был связан к неправильной библиотеке SSL.
Ответ 2
Если httr lib отсутствует, появляется такая же ошибка
попробовать:
install.packages( "HTTR" )
Ответ 3
Я удалил httr (удалив всю папку httr непосредственно из моей R win-библиотеки) и переустановил ее. Затем установка из github работала плавно
Ответ 4
Когда я использую вибрирование библиотеки, я встретил ту же проблему tooooo
После нескольких попыток и поиска я обнаружил, что это потому, что я не установил openssl в R.
Итак:
install.packages("openssl")
тогда все нормально!
О! Я использую Windows 10, а не Linux
Ответ 5
Я получал ту же ошибку с завихрением при отправке заданий для Coursera.
Удаление и переустановка самого вихря, завивка и htrr (который также отсутствовал) не рассматривали проблему. Единственное, что на самом деле работало:
install.packages( "OpenSSL" )
Также используется Windows 10 и R 3.3.3.
Ответ 6
Убедитесь, что в текущей версии R установлен пакет curl: install.packages('curl')
