Ответ 1
Как сказано, для меня работала следующая команда:
sudo apt-get install r-cran-rmysql
Ошибка при установке RMySQL (MySQL 5.5.37 в Ubuntu 14.04)
Каждый раз, когда я пытаюсь установить RMySQL, я получаю следующую ошибку:
Installing package into ‘/home/ehsan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
* installing *source* package ‘RMySQL’ ...
** package ‘RMySQL’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables...
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ANSI C... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for compress in -lz... yes
checking for getopt_long in -lc... yes
checking for mysql_init in -lmysqlclient... yes
checking for egrep... grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking mysql.h usability... no
checking mysql.h presence... no
checking for mysql.h... no
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include/mysql/mysql.h -fpic -O3 -pipe -g -c RS-DBI.c -o RS-DBI.o
cc1: warning: /usr/include/mysql/mysql.h: not a directory [enabled by default]
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include/mysql/mysql.h -fpic -O3 -pipe -g -c RS-MySQL.c -o RS-MySQL.o
cc1: warning: /usr/include/mysql/mysql.h: not a directory [enabled by default]
In file included from RS-MySQL.c:22:0:
RS-MySQL.h:32:19: fatal error: mysql.h: No such file or directory
#include <mysql.h>
^
compilation terminated.
make: *** [RS-MySQL.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘RMySQL’
* removing ‘/home/ehsan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RMySQL’
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpTRRPqg/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("RMySQL") :
installation of package ‘RMySQL’ had non-zero exit status**
По-видимому, он не может найти mysql.h, и я искал и менял путь к
export PKG_CPPFLAGS = "- I/usr/R/include/mysql/mysql.h"
но это не удалось. Много людей, у которых была одна и та же проблема, но не их решения (если они существовали) работали на меня. Я был бы признателен за любые комментарии или помощь.
Обновление: проблема решена
Кажется, что следующая проблема решает проблему:
sudo apt-get install r-cran-rmysql
Ответы
Ответ 2
поскольку @ehsanmo не отправил свой ответ в качестве ответа, тогда я это сделаю и подтвержу, что его решение работает и для меня:
sudo apt-get install r-cran-rmysql
(Я на мяте 12)
Ответ 3
Ну, есть два типа проблем установки/создания. Отсутствуют .h файлы и/или отсутствуют .so/.a libs. Как вы можете видеть из своего журнала, у вас отсутствует .h
Причина для них несколько: 1.- пакет, который их доставляет, не установлен. Это означает, что эти файлы не могут быть найдены нигде в дереве /usr. Решение заключается в установке правильного пакета, убедитесь, что файлы там
2.- Вложения не найдены конфигуратором установки.. Это означает, что некоторые параметры среды или установки не установлены должным образом. Какую переменную установить обычно указывается в документации; в некоторых случаях вам необходимо установить что-то вне R и снова, что обычно указывается в документации.
3.- libs не находятся в LD_LIBRARY_PATH, и, надеюсь, решение этого не требует пояснений.
4.- Существует более глубокая ошибка компиляции/ссылки, что означает, что пакет несовместим с остальной частью sw или не был правильно портирован.
Ответ 4
Моя проблема была решена с помощью следующей команды:
sudo apt-get install libmysql++-dev