Matplotlib очень медленный. Это нормально?

Я создаю пару графиков PDF с matplotlib, который состоит из 400 подзаголовков. Каждый из них имеет только 5 точек данных. Для сохранения 5 pdf-изображений требуется 420 с на хорошем компьютере. Есть ли способ оптимизировать код, или это нормально для matplotlib?

Часть кода для построения:

plot_cnt = 1
for k in np.arange(K_min, K_max + 1):
    for l in np.arange(L_min, L_max + 1):
        ax = plt.subplot(grid[0], grid[1], plot_cnt)
        plot_cnt += 1
        plt.setp(ax, 'frame_on', False)
        ax.set_ylim([-0.1, 1.1])
        ax.set_xlabel('K={},L={}'.format(k, l), size=3)
        ax.set_xlim([-0.1, 4.1])
        ax.set_xticks([])
        ax.set_yticks([])
        ax.grid('off')
        ax.plot(np.arange(5), (data['S1']['Azimuth'][:, k - 1, l + offset_l] + \
                data['S1']['Delta Speed'][:, k - 1, l + offset_l] + \
                data['S1']['Speed'][:, k - 1, l + offset_l]) / 3,
                'r-o', ms=1, mew=0, mfc='r')
        ax.plot(np.arange(5), data['S2'][case][:, k - 1, l + offset_l],
                'b-o', ms=1, mew=0, mfc='b')
plt.savefig(os.path.join(os.getcwd(), 'plot-average.pdf'))
plt.clf()
print 'Final plot created.'

Финал: enter image description here

Ответы

Ответ 1

Создав то, что сказал @rowman, вы можете сделать это все в одной оси (когда вы отключите все тики и т.д.). Что-то вроде:

K_max = 20
K_min = 0
L_max = 20
L_min = 0
ax = plt.subplot(111)
x_offset = 7 # tune these
y_offset = 7 # tune these
plt.setp(ax, 'frame_on', False)
ax.set_ylim([0, (K_max-K_min +1)*y_offset ])
ax.set_xlim([0, (L_max - L_min+1)*x_offset])
ax.set_xticks([])
ax.set_yticks([])
ax.grid('off')



for k in np.arange(K_min, K_max + 1):
    for l in np.arange(L_min, L_max + 1):
        ax.plot(np.arange(5) + l*x_offset, 5+rand(5) + k*y_offset,
                'r-o', ms=1, mew=0, mfc='r')
        ax.plot(np.arange(5) + l*x_offset, 3+rand(5) + k*y_offset,
                'b-o', ms=1, mew=0, mfc='b')
        ax.annotate('K={},L={}'.format(k, l), (2.5+ (k)*x_offset,l*y_offset), size=3,ha='center')
plt.savefig(os.path.join(os.getcwd(), 'plot-average.pdf'))

print 'Final plot created.'

Запуск примерно через секунду или два. Я думаю, что все время тратится на создание объекта axes, который довольно сложный внутри. output with fake data