Как передать массив numpy типов строк в функцию в Cython
Передача массива numpy dtype np.float64_t
работает отлично (ниже), но я не могу передать строковые массивы.
Это то, что работает:
# cython_testing.pyx
import numpy as np
cimport numpy as np
ctypedef np.float64_t dtype_t
cdef func1 (np.ndarray[dtype_t, ndim=2] A):
print A
def testing():
chunk = np.array ( [[94.,3.],[44.,4.]], dtype=np.float64)
func1 (chunk)
Но я не могу выполнить эту работу:
Я не могу найти подходящие идентификаторы типов для numty string dtypes.
# cython_testing.pyx
import numpy as np
cimport numpy as np
ctypedef np.string_t dtype_str_t
cdef func1 (np.ndarray[dtype_str_t, ndim=2] A):
print A
def testing():
chunk = np.array ( [['huh','yea'],['swell','ray']], dtype=np.string_)
func1 (chunk)
Ошибка компиляции:
Error compiling Cython file:
------------------------------------------------------------
ctypedef np.string_t dtype_str_t
^
------------------------------------------------------------
cython_testing.pyx:9:9: 'string_t' is not a type identifier
UPDATE
При просмотре numpy.pxd
я вижу следующие инструкции ctypedef
. Может быть, этого достаточно, чтобы сказать, что я могу использовать uint8_t
и притворяться, что все нормально, до тех пор, пока я могу сделать кастинг?
ctypedef unsigned char npy_uint8
ctypedef npy_uint8 uint8_t
Просто посмотрите, насколько дорого будет кастинг.
Ответы
Ответ 1
Похоже, вам не повезло.
http://cython.readthedocs.org/en/latest/src/tutorial/numpy.html
Некоторые типы данных еще не поддерживаются, например, булевые массивы и массивы строк.
Этот ответ больше не действителен, как показано ответом Сауло Кастро, но я оставлю его в исторических целях.
Ответ 2
С Cython 0.20.1 он работает с использованием cdef np.ndarray
без указания типа данных и количества измерений:
import numpy as np
cimport numpy as np
cdef func1(np.ndarray A):
print A
def testing():
chunk = np.array([['huh','yea'], ['swell','ray']])
func1(chunk)