R: напечатать фрейм данных, созданный с помощью sample() из библиотеки kimisc

Мне нужно перетасовать строки кадра данных, изменив это:

A foo
B bar
C baz

в это:

B foo
C bar
A baz

I.e., первый столбец следует перетасовать, сохраняя остальное неповрежденным. Я делаю это, используя sample() из библиотеки kimisc, как предложено здесь. Пример минимального рабочего кода:

>df<-read.table("file1", header=F, skip=1)
>library(kimisc)
>names<-read.table("file2")
>df1<- transform(sample(df,size=nrow(names)),V1=names)
>df1
  V1    V2
5  A 21266
8  C 22109
7  F 17971
1  J 11137

Где file1 есть

Name Value
A 28463
B 11137
C 24966
D 24611
E 14980
F 21266
G 23441
H 17971
I 22109
J 31746

и file2:

A
C
F
J

Затем я хочу записать этот фрейм данных в файл, и мой ожидаемый результат

A 21266
C 22109
F 17971
J 11137

Однако загрузка библиотеки kimisc предоставляет свою собственную функцию sample, которая (в отличие от ванили) перетасовывает кадр данных так, как я хочу, но, кажется, замаскирует печать:

write.table(df1, "file3", quote = F, sep = '\ t', col = FALSE)

Это приводит к следующему выводу:

5   1:4 21266
8   1:4 22109
7   1:4 17971
1   1:4 11137

Если я использую vanilla sample, генерируемый кадр данных печатается, как ожидалось, но он не перетасовывается так, как мне нужно (т.е. столбцы вместо строк перетасовываются).

Итак, как я могу использовать sample из kimisc, что позволяет мне пробовать строки, а не столбцы кадра данных, и все равно печатать их так, как write.table будет работать с фреймом данных, возвращаемым base::sample?

PS.Я использую список имен, потому что на самом деле я пытаюсь назначить случайные значения из файла, содержащего строки 143558041, подмножеству (39953) имен, упомянутых в этом файле.

В соответствии с запросом вывод dput(df1) равен

> dput(df1)
structure(list(V1 = structure(list(V1 = structure(1:4, .Label = c("A", 
"C", "F", "J"), class = "factor")), .Names = "V1", class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-4L)), V2 = c(24611L, 14980L, 22109L, 21266L)), .Names = c("V1", 
"V2"), row.names = c(3L, 4L, 8L, 5L), class = "data.frame")

Ответы

Ответ 1

Я переработал ваш вклад в воспроизводимый пример:

library(kimisc)

## Loading required package: Rcpp

## Loading required package: logging


set.seed(20130828L)

df <- read.table(text="Name Value
A 28463
B 11137
C 24966
D 24611
E 14980
F 21266
G 23441
H 17971
I 22109
J 31746", header=F, skip=1)

names <- read.table(text="A
C
F
J")

df.s <- sample.data.frame(df,size=nrow(names))
df1<- transform(df.s,V1=names)

dput(df1)

## structure(list(V1 = structure(list(V1 = structure(1:4, .Label = c("A", 
## "C", "F", "J"), class = "factor")), .Names = "V1", class = "data.frame", row.names = c(NA, 
## -4L)), V2 = c(14980L, 21266L, 17971L, 24966L)), .Names = c("V1", 
## "V2"), row.names = c(5L, 6L, 8L, 3L), class = "data.frame")

Как вы можете видеть, результат dput похож на ваш.

Собственно, names - это кадр данных, который встроен в другой фрейм данных. Это не имеет ничего общего с проблемами в sample.data.frame. Два возможных средства:

  • Используйте names$V1 в вызове transform
  • Прочитайте names как вектор, а не как таблицу (осторожно с nrow(names))