Nump hstack - "ValueError: все входные массивы должны иметь одинаковое количество измерений", но они делают
Я пытаюсь присоединиться к двум массивам numpy. У меня есть набор столбцов/функций после запуска TF-IDF в одном столбце текста. В другом я имею один столбец/функцию, которая является целым числом. Поэтому я читаю в столбце данных поезда и теста, запускаю TF-IDF на этом, а затем я хочу добавить еще один целочисленный столбец, потому что я думаю, что это поможет моему классификатору более точно узнать, как он должен себя вести.
К сожалению, я получаю ошибку в заголовке, когда я пытаюсь запустить hstack
, чтобы добавить этот единственный столбец в другой массив numpy.
Вот мой код:
#reading in test/train data for TF-IDF
traindata = list(np.array(p.read_csv('FinalCSVFin.csv', delimiter=";"))[:,2])
testdata = list(np.array(p.read_csv('FinalTestCSVFin.csv', delimiter=";"))[:,2])
#reading in labels for training
y = np.array(p.read_csv('FinalCSVFin.csv', delimiter=";"))[:,-2]
#reading in single integer column to join
AlexaTrainData = p.read_csv('FinalCSVFin.csv', delimiter=";")[["alexarank"]]
AlexaTestData = p.read_csv('FinalTestCSVFin.csv', delimiter=";")[["alexarank"]]
AllAlexaAndGoogleInfo = AlexaTestData.append(AlexaTrainData)
tfv = TfidfVectorizer(min_df=3, max_features=None, strip_accents='unicode',
analyzer='word',token_pattern=r'\w{1,}',ngram_range=(1, 2), use_idf=1,smooth_idf=1,sublinear_tf=1) #tf-idf object
rd = lm.LogisticRegression(penalty='l2', dual=True, tol=0.0001,
C=1, fit_intercept=True, intercept_scaling=1.0,
class_weight=None, random_state=None) #Classifier
X_all = traindata + testdata #adding test and train data to put into tf-idf
lentrain = len(traindata) #find length of train data
tfv.fit(X_all) #fit tf-idf on all our text
X_all = tfv.transform(X_all) #transform it
X = X_all[:lentrain] #reduce to size of training set
AllAlexaAndGoogleInfo = AllAlexaAndGoogleInfo[:lentrain] #reduce to size of training set
X_test = X_all[lentrain:] #reduce to size of training set
#printing debug info, output below :
print "X.shape => " + str(X.shape)
print "AllAlexaAndGoogleInfo.shape => " + str(AllAlexaAndGoogleInfo.shape)
print "X_all.shape => " + str(X_all.shape)
#line we get error on
X = np.hstack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))
Ниже приведен вывод и сообщение об ошибке:
X.shape => (7395, 238377)
AllAlexaAndGoogleInfo.shape => (7395, 1)
X_all.shape => (10566, 238377)
---------------------------------------------------------------------------
ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-12-2b310887b5e4> in <module>()
31 print "X_all.shape => " + str(X_all.shape)
32 #X = np.column_stack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))
---> 33 X = np.hstack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))
34 sc = preprocessing.StandardScaler().fit(X)
35 X = sc.transform(X)
C:\Users\Simon\Anaconda\lib\site-packages\numpy\core\shape_base.pyc in hstack(tup)
271 # As a special case, dimension 0 of 1-dimensional arrays is "horizontal"
272 if arrs[0].ndim == 1:
--> 273 return _nx.concatenate(arrs, 0)
274 else:
275 return _nx.concatenate(arrs, 1)
ValueError: all the input arrays must have same number of dimensions
Что вызывает здесь мою проблему? Как я могу это исправить? Насколько я вижу, я могу присоединиться к этим колонкам? Что я неправильно понял?
Спасибо.
Изменить:
Использование метода в ответе ниже получает следующую ошибку:
---------------------------------------------------------------------------
ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-16-640ef6dd335d> in <module>()
---> 36 X = np.column_stack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))
37 sc = preprocessing.StandardScaler().fit(X)
38 X = sc.transform(X)
C:\Users\Simon\Anaconda\lib\site-packages\numpy\lib\shape_base.pyc in column_stack(tup)
294 arr = array(arr,copy=False,subok=True,ndmin=2).T
295 arrays.append(arr)
--> 296 return _nx.concatenate(arrays,1)
297
298 def dstack(tup):
ValueError: all the input array dimensions except for the concatenation axis must match exactly
Интересно, что я попытался напечатать dtype
X, и это сработало нормально:
X.dtype => float64
Однако, пытаясь напечатать dtype AllAlexaAndGoogleInfo
следующим образом:
print "AllAlexaAndGoogleInfo.dtype => " + str(AllAlexaAndGoogleInfo.dtype)
производит:
'DataFrame' object has no attribute 'dtype'
Ответы
Ответ 1
Поскольку X
- разреженный массив, вместо numpy.hstack
, используйте scipy.sparse.hstack
для объединения массивов. По-моему, сообщение об ошибке вводит в заблуждение.
Этот минимальный пример иллюстрирует ситуацию:
import numpy as np
from scipy import sparse
X = sparse.rand(10, 10000)
xt = np.random.random((10, 1))
print 'X shape:', X.shape
print 'xt shape:', xt.shape
print 'Stacked shape:', np.hstack((X,xt)).shape
#print 'Stacked shape:', sparse.hstack((X,xt)).shape #This works
На основе следующего вывода
X shape: (10, 10000)
xt shape: (10, 1)
можно ожидать, что hstack
в следующей строке будет работать, но факт заключается в том, что он вызывает эту ошибку:
ValueError: all the input arrays must have same number of dimensions
Итак, используйте scipy.sparse.hstack
, когда у вас есть разреженный массив для стека.
Фактически, я ответил на это как комментарий в ваших других вопросах, и вы упомянули, что появляется другое сообщение об ошибке:
TypeError: no supported conversion for types: (dtype('float64'), dtype('O'))
Прежде всего, AllAlexaAndGoogleInfo
не имеет dtype
, так как это DataFrame
. Чтобы получить базовый массив numpy, просто используйте AllAlexaAndGoogleInfo.values
. Проверьте его dtype
. На основе сообщения об ошибке он имеет dtype
из object
, что означает, что он может содержать не численные элементы, такие как строки.
Это минимальный пример, который воспроизводит эту ситуацию:
X = sparse.rand(100, 10000)
xt = np.random.random((100, 1))
xt = xt.astype('object') # Comment this to fix the error
print 'X:', X.shape, X.dtype
print 'xt:', xt.shape, xt.dtype
print 'Stacked shape:', sparse.hstack((X,xt)).shape
Сообщение об ошибке:
TypeError: no supported conversion for types: (dtype('float64'), dtype('O'))
Итак, проверьте, нет ли каких-либо нечисловых значений в AllAlexaAndGoogleInfo
и исправьте их, прежде чем выполнять стекирование.
Ответ 2
Используйте .column_stack
. Например:
X = np.column_stack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))
Из docs:
Возьмите последовательность 1-D массивов и соедините их как столбцы, чтобы сделать одиночный 2-мерный массив. 2-D массивы складываются как есть, так же, как и с hstack.
Ответ 3
Try:
X = np.hstack((X, AllAlexaAndGoogleInfo.values))
У меня нет работающего модуля Pandas, поэтому он не может его протестировать. Но документация DataFrame описывает values Numpy representation of NDFrame
. np.hstack
является функцией numpy
и как таковая ничего не знает о внутренней структуре DataFrame
.