Есть ли удобный способ применить таблицу поиска к большому массиву в numpy?
Ive получил изображение, читаемое в numpy с довольно большим количеством пикселей в моем результирующем массиве.
Я вычислил таблицу поиска с 256 значениями. Теперь я хочу сделать следующее:
for i in image.rows:
for j in image.cols:
mapped_image[i,j] = lut[image[i,j]]
Да, это в основном то, что делает lut.
Единственная проблема заключается в следующем: я хочу сделать это эффективным, и вызов этого цикла в python заставит меня ждать несколько секунд, чтобы он закончил.
Я знаю numpy.vectorize()
, это просто удобная функция, которая вызывает тот же код python.
Ответы
Ответ 1
Вы можете просто использовать image
для индексации в lut
, если lut
- 1D.
Здесь стартер по индексированию в NumPy:
http://www.scipy.org/Tentative_NumPy_Tutorial#head-864862d3f2bb4c32f04260fac61eb4ef34788c4c
In [54]: lut = np.arange(10) * 10
In [55]: img = np.random.randint(0,9,size=(3,3))
In [56]: lut
Out[56]: array([ 0, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90])
In [57]: img
Out[57]:
array([[2, 2, 4],
[1, 3, 0],
[4, 3, 1]])
In [58]: lut[img]
Out[58]:
array([[20, 20, 40],
[10, 30, 0],
[40, 30, 10]])
Обратите внимание, что индексирование начинается с 0
Ответ 2
TheodrosZelleke ответил правильно, но я просто хотел добавить к нему немного недокументированной мудрости. Numpy предоставляет функцию np.take
, которая согласно документации "делает то же самое, что и причудливое индексирование".
Ну, почти, но не совсем то же самое:
>>> import numpy as np
>>> lut = np.arange(256)
>>> image = np.random.randint(256, size=(5000, 5000))
>>> np.all(lut[image] == np.take(lut, image))
True
>>> import timeit
>>> timeit.timeit('lut[image]',
... 'from __main__ import lut, image', number=10)
4.369504285407089
>>> timeit.timeit('np.take(lut, image)',
... 'from __main__ import np, lut, image', number=10)
1.3678052776554637
np.take
примерно в 3 раза быстрее! По моему опыту, при использовании 3D-изображений для преобразования изображений из RGB в другие цветовые пространства добавление логики для преобразования 3D-вида в одномерный сплющенный поиск позволяет ускорить x10.