Ответ 1
Короче: Да. (По всем трем вопросам.)
Обратите внимание, что YARD в основном обратная совместимость с RDoc, по крайней мере, до разметки. (Плагины RDoc OTOH не работают с YARD.) Таким образом, вы можете использовать YARD для обработки устаревших файлов RDoc. YARD - это, прежде всего, правильный набор RDoc.