Ответ 1
HKEY_CURRENT_USER\Software\Саймон Тэтхем\PuTTY\Сессии
Похоже, что где-то в реестре.
Пробовал запускать разные файлы exec - сеансы одинаковы.
HKEY_CURRENT_USER\Software\Саймон Тэтхем\PuTTY\Сессии
HKEY_CURRENT_USER\Программное обеспечение \SimonTatham\PuTTY в SshHostKeys или сеансах