Ответ 1
Если у вас есть класс сущности (Руководство по репозиторию Doctrine):
$records = $em->getRepository("Entities\YourTargetEntity")->findAll();
Если у вас нет класса entity (руководство PDO):
$pdo = $em->getCurrentConnection()->getDbh();
$result = $pdo->query("select * from table"); //plain sql query here, it just PDO
$records = $pdo->fetchAll();