Тензорный поток: как отображать пользовательские изображения в тензокарте (например, графики Matplotlib)
В разделе Image Dashboard раздела Tendorboard ReadMe говорится:
Поскольку панель управления изображения поддерживает произвольные png, вы можете использовать это для встраивания пользовательских визуализаций (например, матплотблибковых диаграмм) в TensorBoard.
Я вижу, как изображение pyplot можно было записать в файл, прочитать в виде тензора, а затем использовать с tf.image_summary(), чтобы записать его в TensorBoard, но это утверждение из readme предполагает, что существует более прямой способ, Здесь? Если да, есть ли дополнительная документация и/или примеры того, как это сделать эффективно?
Ответы
Ответ 1
Это очень легко сделать, если у вас есть изображение в буфере памяти. Ниже я показываю пример, в котором пипот сохраняется в буфере, а затем преобразуется в представление изображения TF, которое затем отправляется в сводку изображений.
import io
import matplotlib.pyplot as plt
import tensorflow as tf
def gen_plot():
"""Create a pyplot plot and save to buffer."""
plt.figure()
plt.plot([1, 2])
plt.title("test")
buf = io.BytesIO()
plt.savefig(buf, format='png')
buf.seek(0)
return buf
# Prepare the plot
plot_buf = gen_plot()
# Convert PNG buffer to TF image
image = tf.image.decode_png(plot_buf.getvalue(), channels=4)
# Add the batch dimension
image = tf.expand_dims(image, 0)
# Add image summary
summary_op = tf.summary.image("plot", image)
# Session
with tf.Session() as sess:
# Run
summary = sess.run(summary_op)
# Write summary
writer = tf.train.SummaryWriter('./logs')
writer.add_summary(summary)
writer.close()
Это дает следующую визуализацию TensorBoard:
Ответ 2
Далее script не использует промежуточную кодировку RGB/PNG. Это также устраняет проблему с дополнительной конструкцией операции во время выполнения, повторное использование одного резюме.
Ожидается, что размер фигуры останется неизменным во время выполнения
Решение, которое работает:
import matplotlib.pyplot as plt
import tensorflow as tf
import numpy as np
def get_figure():
fig = plt.figure(num=0, figsize=(6, 4), dpi=300)
fig.clf()
return fig
def fig2rgb_array(fig, expand=True):
fig.canvas.draw()
buf = fig.canvas.tostring_rgb()
ncols, nrows = fig.canvas.get_width_height()
shape = (nrows, ncols, 3) if not expand else (1, nrows, ncols, 3)
return np.fromstring(buf, dtype=np.uint8).reshape(shape)
def figure_to_summary(fig):
image = fig2rgb_array(fig)
summary_writer.add_summary(
vis_summary.eval(feed_dict={vis_placeholder: image}))
if __name__ == '__main__':
# construct graph
x = tf.Variable(initial_value=tf.random_uniform((2, 10)))
inc = x.assign(x + 1)
# construct summary
fig = get_figure()
vis_placeholder = tf.placeholder(tf.uint8, fig2rgb_array(fig).shape)
vis_summary = tf.summary.image('custom', vis_placeholder)
with tf.Session() as sess:
tf.global_variables_initializer().run()
summary_writer = tf.summary.FileWriter('./tmp', sess.graph)
for i in range(100):
# execute step
_, values = sess.run([inc, x])
# draw on the plot
fig = get_figure()
plt.subplot('111').scatter(values[0], values[1])
# save the summary
figure_to_summary(fig)
Ответ 3
Немного поздно с моим ответом. С tf-matplotlib простой график рассеяния сводится к:
import tensorflow as tf
import numpy as np
import tfmpl
@tfmpl.figure_tensor
def draw_scatter(scaled, colors):
'''Draw scatter plots. One for each color.'''
figs = tfmpl.create_figures(len(colors), figsize=(4,4))
for idx, f in enumerate(figs):
ax = f.add_subplot(111)
ax.axis('off')
ax.scatter(scaled[:, 0], scaled[:, 1], c=colors[idx])
f.tight_layout()
return figs
with tf.Session(graph=tf.Graph()) as sess:
# A point cloud that can be scaled by the user
points = tf.constant(
np.random.normal(loc=0.0, scale=1.0, size=(100, 2)).astype(np.float32)
)
scale = tf.placeholder(tf.float32)
scaled = points*scale
# Note, 'scaled' above is a tensor. Its being passed 'draw_scatter' below.
# However, when 'draw_scatter' is invoked, the tensor will be evaluated and a
# numpy array representing its content is provided.
image_tensor = draw_scatter(scaled, ['r', 'g'])
image_summary = tf.summary.image('scatter', image_tensor)
all_summaries = tf.summary.merge_all()
writer = tf.summary.FileWriter('log', sess.graph)
summary = sess.run(all_summaries, feed_dict={scale: 2.})
writer.add_summary(summary, global_step=0)
При выполнении это приводит к следующему графику внутри Tensorboard
Обратите внимание, что tf-matplotlib заботится об оценке любых тензорных входов, избегает pyplot
резьбой на pyplot
и поддерживает блиты для критического построения времени выполнения.
Ответ 4
Это намеревается завершить ответ Анджей Pronobis. Следуя внимательно своему хорошему сообщению, я настроил этот минимальный рабочий пример:
plt.figure()
plt.plot([1, 2])
plt.title("test")
buf = io.BytesIO()
plt.savefig(buf, format='png')
buf.seek(0)
image = tf.image.decode_png(buf.getvalue(), channels=4)
image = tf.expand_dims(image, 0)
summary = tf.summary.image("test", image, max_outputs=1)
writer.add_summary(summary, step)
Где автор является экземпляром tf.summary.FileWriter.
Это дало мне следующую ошибку:
AttributeError: объект "Тензор" не имеет атрибута "значение"
Для чего этот столбец github имел решение: сводка должна быть оценена (преобразована в строку) перед добавлением к записи. Таким образом, рабочий код для меня остался следующим (просто добавьте вызов .eval() в последней строке):
plt.figure()
plt.plot([1, 2])
plt.title("test")
buf = io.BytesIO()
plt.savefig(buf, format='png')
buf.seek(0)
image = tf.image.decode_png(buf.getvalue(), channels=4)
image = tf.expand_dims(image, 0)
summary = tf.summary.image("test", image, max_outputs=1)
writer.add_summary(summary.eval(), step)
Это может быть достаточно коротким, чтобы быть комментарием к его ответу, но их можно легко упустить (и я могу делать что-то другое по-другому), так что вот оно, надеюсь, это поможет!
Cheers,
Андрес