Построение двух векторов данных на графике рассеяния GGPLOT2 с использованием R
Я экспериментировал как с ggplot2
и с lattice
для ggplot2
панелей данных. У меня возникли небольшие проблемы, когда я ggplot2
модель ggplot2
. В частности, как мне построить точечную диаграмму с двумя наборами данных на каждой панели:
в lattice
я мог бы сделать это:
xyplot(Predicted_value + Actual_value ~ x_value | State_CD, data=dd)
и это дало бы мне панель для каждого State_CD с каждым столбцом
Я могу сделать один столбец с ggplot2
:
pg <- ggplot(dd, aes(x_value, Predicted_value)) + geom_point(shape = 2)
+ facet_wrap(~ State_CD) + opts(aspect.ratio = 1)
print(pg)
Я не могу понять, как добавить Actual_value в ggplot выше.
РЕДАКТИРОВАТЬ Хэдли указал, что это действительно будет проще с воспроизводимым примером. Вот код, который, кажется, работает. Есть ли лучший или более краткий способ сделать это с помощью ggplot? Почему синтаксис для добавления другого набора точек в ggplot так отличается от добавления первого набора данных?
library(lattice)
library(ggplot2)
#make some example data
dd<-data.frame(matrix(rnorm(108),36,3),c(rep("A",24),rep("B",24),rep("C",24)))
colnames(dd) <- c("Predicted_value", "Actual_value", "x_value", "State_CD")
#plot with lattice
xyplot(Predicted_value + Actual_value ~ x_value | State_CD, data=dd)
#plot with ggplot
pg <- ggplot(dd, aes(x_value, Predicted_value)) + geom_point(shape = 2) + facet_wrap(~ State_CD) + opts(aspect.ratio = 1)
print(pg)
pg + geom_point(data=dd,aes(x_value, Actual_value,group=State_CD), colour="green")
Выход решетки выглядит следующим образом:
(источник: cerebralmastication.com)
и ggplot выглядит так:
(источник: cerebralmastication.com)
Ответы
Ответ 1
Просто следуя тому, что предложил Ян: для ggplot2 вы действительно хотите, чтобы все элементы оси Y в одном столбце с другим столбцом в качестве фактора, указывающего, как вы хотите его украсить. Это легко сделать с помощью melt
. Для остроумия:
qplot(x_value, value,
data = melt(dd, measure.vars=c("Predicted_value", "Actual_value")),
colour=variable) + facet_wrap(~State_CD)
Вот как это выглядит для меня:
(источник: princeton.edu)
Чтобы понять, что на самом деле делает melt
, вот глава:
> head(melt(dd, measure.vars=c("Predicted_value", "Actual_value")))
x_value State_CD variable value
1 1.2898779 A Predicted_value 1.0913712
2 0.1077710 A Predicted_value -2.2337188
3 -0.9430190 A Predicted_value 1.1409515
4 0.3698614 A Predicted_value -1.8260033
5 -0.3949606 A Predicted_value -0.3102753
6 -0.1275037 A Predicted_value -1.2945864
Видите ли, он "плавит" Predicted_value и Actual_value в один столбец с именем value
и добавляет еще один столбец с именем variable
позволяющий узнать, из какого столбца он изначально пришел.
Ответ 2
Обновить: через несколько лет я почти всегда использую метод Джонатана (через пакет tidyr) с ggplot2. Мой ответ ниже работает в крайнем случае, но получает утомительно быстро, когда у вас есть переменные 3+.
Я уверен, что у Хэдли будет лучший ответ, но - синтаксис отличается, потому что синтаксис ggplot(dd,aes())
(я думаю) в первую очередь предназначен для построения только одной переменной. Для двоих я бы использовал:
ggplot() +
geom_point(data=dd, aes(x_value, Actual_value, group=State_CD), colour="green") +
geom_point(data=dd, aes(x_value, Predicted_value, group=State_CD), shape = 2) +
facet_wrap(~ State_CD) +
theme(aspect.ratio = 1)
Вытягивание первого набора точек из ggplot() дает ему тот же синтаксис, что и второй. С этим легче справиться, потому что синтаксис один и тот же, и он подчеркивает "Грамматику графики", которая лежит в основе ggplot2.
Ответ 3
вы можете просто немного изменить форму своих данных, так что у вас есть одна переменная оси y с дополнительной факторной переменной, указывающей, является ли она прогнозируемой или фактической переменной.
Это что-то вроде того, что вы пытаетесь сделать?
dd<-data.frame(type=rep(c("Predicted_value","Actual_value"),20),y_value=rnorm(40),
x_value=rnorm(40),State_CD=rnorm(40)>0)
qplot(x_value,y_value,data=dd,colour=type,facets=.~State_CD)
Ответ 4
после публикации вопроса я наткнулся на этот раздел справки R, который, возможно, помог мне. Похоже, я могу это сделать:
pg + geom_line(data=dd,aes(x_value, Actual_value,group=State_CD), colour="green")
- это хороший способ сделать что-то? Это странно для меня, потому что добавление второго элемента имеет совершенно другой синтаксис, чем первый.