"RuntimeError: убедитесь, что исполняемые файлы Graphviz находятся на вашем системном пути" после установки Graphviz 2.38

Я загрузил версию Graphviz 2.38 MSI и установил в папке C:\Python34, затем запустил pip install Graphviz, все прошло хорошо. В системном пути я добавил C:\Python34\bin. Когда я попытался запустить тест script, в строке filename=dot.render(filename='test'), я получил сообщение

 RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

Я попытался поместить "C:\Python34\bin\dot.exe" в системный путь, но это не сработало, и я даже создал новую переменную среды "GRAPHVIZ_DOT" со значением "C:\Python34\bin\dot.exe", все еще не работая. Я попытался удалить Graphviz и pip удалить Graphviz, а затем переустановить его и снова установить pip, но ничего не работает.

Все сообщение трассировки:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 220, in render
    proc = subprocess.Popen(cmd, startupinfo=STARTUPINFO)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 859, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 1112, in _execute_child
    startupinfo)
FileNotFoundError: [WinError 2] The system cannot find the file specified

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\Documents\Kissmetrics\curves and lines\eventNodes.py", line 56, in <module>
    filename=dot.render(filename='test')
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 225, in render
    'are on your systems\' path' % cmd)
RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

Есть ли у кого-нибудь опыт?

Ответы

Ответ 1

Вам следует установить пакет graphviz в вашей системе (а не только пакет python). На Ubuntu вы должны попробовать:

sudo apt-get install graphviz

Ответ 2

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

В окнах просто добавьте эти две строки в начале, где "D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/" заменяется адресом, где находится ваш файл bin.

Это решает проблему.

Ответ 3

Этот решил проблему для меня на MAC:

  brew install graphviz

Ответ 4

Для Windows:

  1. Установить пакет Windows с: https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html
  2. Установить пакет Python graphviz
  3. Добавьте C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin в Путь пользователя
  4. Добавьте C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe в системный путь

Это сработало для меня!

Ответ 5

OSX Sierra, Python 2.7, Graphviz 2.38

Использование pip install graphviz и conda install graphviz BOTH устраняет проблему.

pip получает только проблему с пути, аналогичную вашей, а conda получает ошибку импорта.

Ответ 6

Попробуйте использовать:

conda install python-graphviz

Исполняемый файл graphviz находится по пути, отличному от вашего каталога pip install graphviz, если вы используете pip install graphviz.

Ответ 7

Просто добавьте ниже в свою экологическую переменную (систему) PATH на Windows

C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin

вы можете найти .exe файлы

Если не работает

Найдите Graphviz2.38/bin папку в программных файлах не в python lib

Затем добавьте к PATH

Важно найти папку с файлами .exe

Ответ 8

Попробуйте conda install graphviz. У меня была та же проблема, я решил ее по указанной команде в MacOS.

Ответ 9

conda install python-graphviz

Для Windows установите Python Graphviz, который будет включать исполняемые файлы в путь.

Ответ 10

Шаг 1: Установите двоичный файл Graphviz

Окна:

  1. Загрузите Graphviz с http://www.graphviz.org/download/
  2. Добавьте ниже в переменную окружения PATH (упомяните установленную версию graphviz):
    • C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin
    • C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe
  3. Закройте все открытые записные книжки Juypter и командную строку
  4. Перезапустите подсказку Jupyter/cmd и проверьте

Linux:

  1. sudo apt-get update
  2. sudo apt-get установить graphviz
  3. или создайте его вручную с http://www.graphviz.org/download/

Шаг 2: Установите модуль graphviz для python

пип:

  • pip install graphviz

Конда:

  • Конда установить графвиз

Ответ 11

У меня была такая же проблема с Linux с Jupyter.

Чтобы решить эту проблему, я добавил библиотеку точек в python sys.path

Сначала: проверьте, установлен ли dot,

Тогда:
найти его путь whereis dot → /local/notebook/miniconda2/envs/ik2/bin/dot

Наконец, в python script: sys.path.append( "/локальный/ноутбук/miniconda2/envs/ik2/бен/точка" )

Ответ 12

После установки пакета (ссылка, если вы этого не сделали), добавьте путь к dot.exe в качестве новой системы переменная.

Путь по умолчанию:

C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe

введите описание изображения здесь

Ответ 13

Сначала вы должны использовать pip install, а затем загрузить другой пакет в http://www.graphviz.org/Download_windows.php и добавьте место установки в экологический путь, затем он работает.

Ответ 14

У меня было такое же сообщение об ошибке в Mac OS (El Capitan), используя IDE PyCharm. Я установил Graphviz, используя brew, как рекомендовано в ответе RZK, и установил пакет python graphviz с помощью PyCharm (я мог проверить, что Graphviz был установлен правильно, попробовав dot -V в терминале и получив: dot - graphviz version 2.40.1 (20161225.0304)). Тем не менее, я все еще получал сообщение об ошибке при попытке вызвать Graphviz из PyCharm.

Мне пришлось добавить путь /usr/local/bin в параметрах PyCharm, как рекомендовано в ответе этот вопрос, чтобы решить проблему.

Ответ 15

Для пользователей Linux, которые не имеют root-доступа и, следовательно, не могут использовать команду sudo как предложено в других ответах...

Сначала активируйте виртуальную среду conda (если вы хотите ее использовать):

source activate virtual-env-name

Затем установите graphviz, даже если вы уже сделали это с помощью pip:

conda install graphviz

затем скопируйте результат следующей команды:

whereis dot

В моем случае его вывод:

/home/nader/anaconda2/bin/dot

и добавьте его в переменную PATH. Просто запустите команду ниже

nano ~/.bashrc

и добавьте эти строки в конец открытого файла:

PATH="/home/username/anaconda2/bin/dot:$PATH"
export PATH

Теперь нажмите Ctrl + O, а затем Ctrl + X для сохранения и выхода.

Проблема должна быть решена к настоящему времени.

Пользователи Pycharm, обратите внимание: Pycharm не всегда видит переменную PATH так же, как ваш терминал. Это решение не работает для Pycharm и, возможно, других IDE. Но вы можете исправить это, добавив следующую строку кода:

os.environ["PATH"] += os.pathsep + '/home/nader/anaconda2/bin'

в вашу программу на Python. Не забудь

import os

первый :)

Edit: Если вы не хотите использовать Конду, вы можете установить Graphviz из здесь без каких - либо разрешений корня и добавьте папку бин в переменную PATH. Я не проверял это.

Ответ 16

1.Установите пакет Windows из: https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html и загрузите файл MSI.

Добавьте в переменные среды 2. Добавьте C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin в путь пользователя

  1. Добавьте C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe в системный путь

  2. Перезапустите тетрадь Python.

Это будет работать.

Ответ 17

Используя conda install graphviz и conda install graphviz conda install python-graphviz для установки GraphViz на Windows10, мне понадобился путь C: /ProgramData/Anaconda3/Library/bin/graphviz/. Т.е. добавление

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/ProgramData/Anaconda3/Library/bin/graphviz/'

решил проблему для меня.

Ответ 18

ОС Mojave 10.14., Python 3.6

Использование pip install graphviz хорошо зарекомендовал себя в терминале, но привел к этой ошибке, когда я попытался построить график в блокноте Jupyter. Затем я запустил brew install graphviz, который выдал ошибку в терминале. Затем я запустил conda install graphviz и график работал.

Из комментария @Leighton: у pip проблема с путями только та же, что и у вас, а у conda только ошибка импорта.

Ответ 19

1) Graphviz - скачать разархивировать в определенном месте в системе (pip не работает в Windows) и включить папку bin в путь ('установить переменные среды в Windows ИЛИ), установленный вручную в каждой программе

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/GraphViz/bin'

2) Затем положите модель на сюжет

clf = xgb.train(params, d_train, 1000, evals=evallist, early_stopping_rounds=10)
xgb.plot_tree(clf)
plt.rcParams['figure.figsize'] = [50, 10]
plt.show()

Ответ 20

пытаясь сделать это в python import sys! conda install --yes --prefix {sys.prefix} graphviz import graphviz