Прочтите файл XML XML.xls с помощью pandas
Я знаю несколько ранее заданных вопросов, но ни одно из решений, приведенных в работе, не воспроизводится на воспроизводимом примере, представленном ниже.
Я пытаюсь читать в .xls
файлах из http://www.eia.gov/coal/data.cfm#production - в частности, данные Исторические подробные данные по добыче угля (1983 год) -2013) coalpublic2012.xls
, который свободно доступен через выпадающий список. Pandas не может его прочитать.
Напротив, файл за последний год, доступный в 2013 году, coalpublic2013.xls
, работает без проблем:
import pandas as pd
df1 = pd.read_excel("coalpublic2013.xls")
но следующее десятилетие файлов .xls
(2004-2012) не загружается. Я просмотрел эти файлы с помощью Excel, и они открываются и не повреждаются.
Ошибка, которую я получаю от Pandas:
---------------------------------------------------------------------------
XLRDError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-28-0da33766e9d2> in <module>()
----> 1 df = pd.read_excel("coalpublic2012.xlsx")
/Users/jonathan/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pandas/io/excel.pyc in read_excel(io, sheetname, header, skiprows, skip_footer, index_col, parse_cols, parse_dates, date_parser, na_values, thousands, convert_float, has_index_names, converters, engine, **kwds)
161
162 if not isinstance(io, ExcelFile):
--> 163 io = ExcelFile(io, engine=engine)
164
165 return io._parse_excel(
/Users/jonathan/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pandas/io/excel.pyc in __init__(self, io, **kwds)
204 self.book = xlrd.open_workbook(file_contents=data)
205 else:
--> 206 self.book = xlrd.open_workbook(io)
207 elif engine == 'xlrd' and isinstance(io, xlrd.Book):
208 self.book = io
/Users/jonathan/anaconda/lib/python2.7/site-packages/xlrd/__init__.pyc in open_workbook(filename, logfile, verbosity, use_mmap, file_contents, encoding_override, formatting_info, on_demand, ragged_rows)
433 formatting_info=formatting_info,
434 on_demand=on_demand,
--> 435 ragged_rows=ragged_rows,
436 )
437 return bk
/Users/jonathan/anaconda/lib/python2.7/site-packages/xlrd/book.pyc in open_workbook_xls(filename, logfile, verbosity, use_mmap, file_contents, encoding_override, formatting_info, on_demand, ragged_rows)
89 t1 = time.clock()
90 bk.load_time_stage_1 = t1 - t0
---> 91 biff_version = bk.getbof(XL_WORKBOOK_GLOBALS)
92 if not biff_version:
93 raise XLRDError("Can't determine file BIFF version")
/Users/jonathan/anaconda/lib/python2.7/site-packages/xlrd/book.pyc in getbof(self, rqd_stream)
1228 bof_error('Expected BOF record; met end of file')
1229 if opcode not in bofcodes:
-> 1230 bof_error('Expected BOF record; found %r' % self.mem[savpos:savpos+8])
1231 length = self.get2bytes()
1232 if length == MY_EOF:
/Users/jonathan/anaconda/lib/python2.7/site-packages/xlrd/book.pyc in bof_error(msg)
1222 if DEBUG: print("reqd: 0x%04x" % rqd_stream, file=self.logfile)
1223 def bof_error(msg):
-> 1224 raise XLRDError('Unsupported format, or corrupt file: ' + msg)
1225 savpos = self._position
1226 opcode = self.get2bytes()
XLRDError: Unsupported format, or corrupt file: Expected BOF record; found '<?xml ve'
И я пробовал разные вещи:
df = pd.ExcelFile("coalpublic2012.xls", encoding_override='cp1252')
import xlrd
wb = xlrd.open_workbook("coalpublic2012.xls")
безрезультатно. Моя версия Pandas: 0.17.0
Я также представил это как ошибку в списке Pandas github issues.
Ответы
Ответ 1
Вы можете преобразовать этот файл Excel XML программно. Требование: только python и pandas.
import pandas as pd
from xml.sax import ContentHandler, parse
# Reference https://goo.gl/KaOBG3
class ExcelHandler(ContentHandler):
def __init__(self):
self.chars = [ ]
self.cells = [ ]
self.rows = [ ]
self.tables = [ ]
def characters(self, content):
self.chars.append(content)
def startElement(self, name, atts):
if name=="Cell":
self.chars = [ ]
elif name=="Row":
self.cells=[ ]
elif name=="Table":
self.rows = [ ]
def endElement(self, name):
if name=="Cell":
self.cells.append(''.join(self.chars))
elif name=="Row":
self.rows.append(self.cells)
elif name=="Table":
self.tables.append(self.rows)
excelHandler = ExcelHandler()
parse('coalpublic2012.xls', excelHandler)
df1 = pd.DataFrame(excelHandler.tables[0][4:], columns=excelHandler.tables[0][3])
Ответ 2
Проблема заключается в том, что, хотя данные 2013 года являются фактическим файлом Excel, данные 2012 года являются XML-документом, что, кажется, не поддерживается в Python. Я бы сказал, что лучше всего открыть его в Excel и сохранить копию как файл Excel или CSV.
Ответ 3
Вы можете преобразовать этот файл Excel XML программно.
Требование: Windows, Office установлены.
1.Создание в блокноте ExcelToCsv.vbs script:
if WScript.Arguments.Count < 3 Then
WScript.Echo "Please specify the source and the destination files. Usage: ExcelToCsv <xls/xlsx source file> <csv destination file> <worksheet number (starts at 1)>"
Wscript.Quit
End If
csv_format = 6
Set objFSO = CreateObject("Scripting.FileSystemObject")
src_file = objFSO.GetAbsolutePathName(Wscript.Arguments.Item(0))
dest_file = objFSO.GetAbsolutePathName(WScript.Arguments.Item(1))
worksheet_number = CInt(WScript.Arguments.Item(2))
Dim oExcel
Set oExcel = CreateObject("Excel.Application")
Dim oBook
Set oBook = oExcel.Workbooks.Open(src_file)
oBook.Worksheets(worksheet_number).Activate
oBook.SaveAs dest_file, csv_format
oBook.Close False
oExcel.Quit
- Преобразование XML файла Excel в CSV:
$ cscript ExcelToCsv.vbs coalpublic2012.xls coalpublic2012.csv 1
- Откройте CSV файл с помощью pandas
>>> df1 = pd.read_csv('coalpublic2012.csv', skiprows=3)
Ссылка: Более быстрый способ чтения файлов Excel в pandas dataframe