Ответ 1
После разрешения конфликта вы просто вызываете
git flow release finish [RELEASE_NAME]
снова. git является "умным" в том смысле, что если вы попытаетесь слить из ветки A в ветвь B более одного раза, второе и последующее время будут проигнорированы с помощью "Уже обновлено", пока источник слияния не изменен.