Измененные файлы под управлением версии отображаются с темно-коричневым фоном в проводнике проекта, что делает имена файлов нечитаемыми. Я хотел бы изменить его.
Я переключался между несколькими цветовыми темами, но они не влияют на цвета в проводнике проекта. Я не нашел полезных параметров ни в меню General->Appearance->Colors&Fonts, ни в меню Team->Git.
Щелчок правой кнопкой мыши по цветному имени файла не дает возможности изменить цвет, как это происходит при использовании внутри редактора.
Я использую eclipse 3.7 SR2 с EGit.
EDIT: я могу подтвердить, что это декоратор git, обеспечивающий цвета - как только я отключу его (General- > Appearance- > Label decorators), коричневый цвет исчез.
Настройки, которые вы хотите, находятся в разделе "Настройки" > "Основные" > "Внешний вид" > "Цвета и шрифты", найдите раздел " Git" в списке и в нем "Незафиксированные изменения (фон)" и "Uncommitted Change (Foreground)".
Я отредактировал эти настройки как светло-синий фон с белым фоном, и это то, что измененный файл выглядит в моем Project/Package Explorers:
Другая подобная функция не в проводнике проекта, а в правом файле - QuickDiff. Это функция, которая сообщает нам все время, когда вы изменили, добавили и удалили, всегда сравнивая с тем, что было переписано. Чтобы включить это, сделайте это Окно → Настройки → Быстрый Diff → Включить быстрый разгон Окно → Настройки → Быстрый Diff → Использовать этот исходный источник → Git Есть вариант
Измените цвет, который вы хотите указать, что изменилось, добавлено и удалено. Я использую желтый, зеленый и красный соответственно. Затем, в любое время, вы находитесь в файле, всегда будет видна какая строка, которую вы отредактировали, и можете навести курсор на номера строк (которые будут окрашены в розовый, синий или любой цвет, который вы выбрали), чтобы увидеть, что именно вы изменен vs Git. 
Я думаю, вы пропустили шаг.
Теперь вы можете изменить внешний вид измененных файлов.