Изменить цветовую палитру по умолчанию в ggplot

Ответ 1

@baptiste указал мне сообщение на доске сообщений, в котором упоминается функция set_default_scale, которая может использоваться для установки палитры по умолчанию. Однако следующее решение работает только со старыми версиями ggplot2.

Сначала нам нужна функция, которая создает имена цветов или коды. Я назвал мой magazine.colours:

magazine.colours <- function(n, set=NULL) {
  set <- match.arg(set, c('1', '2'))
  palette <- c("red4", "darkslategray3", "dodgerblue1", "darkcyan",
               "gray79", "black", "skyblue2", "dodgerblue4",
               "purple4", "maroon", "chocolate1", "bisque3", "bisque",
               "seagreen4", "lightgreen", "skyblue4", "mediumpurple3",
               "palevioletred1", "lightsalmon4", "darkgoldenrod1")
  if (set == 2)
    palette <- rev(palette)
  if (n > length(palette))
    warning('generated palette has duplicated colours')
  rep(palette, length.out=n)
}

(Он принимает необязательный аргумент set, чтобы показать, что вы не ограничены одной палитрой.) Хорошо, теперь мы создаем "масштаб", который я назвал magazine. Он основан на шкале пивовара ggplot и код довольно уродливый:

ScaleMagazine <- proto(ScaleColour, expr={
  objname <- 'magazine'
  new <- function(., name=NULL, set=NULL, na.colour='yellowgreen',
                  limits=NULL, breaks = NULL, labels=NULL,
                  formatter = identity, variable, legend = TRUE) {
    b_and_l <- check_breaks_and_labels(breaks, labels)
    .$proto(name=name, set=set, .input=variable, .output=variable,
            .labels = b_and_l$labels, breaks = b_and_l$breaks,
            limits= limits, formatter = formatter, legend = legend,
            na.colour = na.colour)
  }
  output_set <- function(.) {
    missing <- is.na(.$input_set())
    n <- sum(!missing)
    palette <- magazine.colours(n, .$set)
    missing_colour(palette, missing, .$na.colour)
  }
  max_levels <- function(.) Inf
})
scale_colour_magazine <- ScaleMagazine$build_accessor(list(variable = '"colour"'))
scale_fill_magazine <- ScaleMagazine$build_accessor(list(variable = '"fill"'))

Важно здесь определить output_set, которая является функцией, которую ggplot вызывает для получения имен/кодов цветов. Кроме того, если вам нужны дополнительные аргументы, они должны быть включены в new, а позже могут быть доступны как .$argument_name. В приведенном выше примере output_set просто вызывает magazine.colours.

Теперь проверьте, действительно ли работает новый масштаб:

qplot(mpg, wt, data=mtcars, shape=21,
      colour=factor(carb), fill=factor(carb)) +
  scale_colour_magazine(set='1') +
  scale_fill_magazine(set='1')

Чтобы сделать это по умолчанию, просто используйте set_default_scale.

set_default_scale("colour", "discrete", "magazine") 
set_default_scale("fill", "discrete", "magazine") 

И это будет.

> qplot(mpg, wt, data=mtcars, colour=factor(carb), fill=factor(carb))

Ответ 2

Чтобы переопределить цветовую шкалу по умолчанию, вы также можете просто переопределить функцию ggplot:

ggplot <- function(...) ggplot2::ggplot(...) + scale_color_brewer(palette="Spectral")

То же самое работает для шкалы заполнения.

Ответ 3

Просто назначьте переменную с именем нужного масштаба:

scale_colour_discrete <- function(...)
  scale_colour_manual(..., values = c('dodgerblue1', *))

Это работает, поскольку ggplot, по возможности, по умолчанию использует масштаб по умолчанию из глобальной среды, аналогично:

get('scale_colour_discrete', envir = globalenv())