Отладка (строка за строкой) Rcpp-сгенерированной DLL под Windows

Ответ 1

Я немного ошеломлен навязчивой идеей Rcpp у пользователей есть inline и cxxfunction(). Да, это действительно очень полезно, и это, несомненно, привело к принятию Rcpp, поскольку это упрощает эксперименты. Да, это позволило нам использовать более 700 единичных тестов в источниках. Да, я использую его все время, чтобы продемонстрировать примеры здесь, в rcpp-devel list или даже жить в presentations.

Но значит ли это, что мы должны использовать его для каждой задачи? Означает ли это, что у него нет "затрат", таких как рандомизированные имена файлов во временном каталоге и т.д. Pp? В нашей документации Ромен и я утверждали иначе.

Наконец, отладка динамически загруженных R-модулей затруднена. Существует целый раздел (обязательный) Написание R-расширений об этом, и Дуг Бэйтс однажды или дважды разместил учебник о том, как это сделать через ESS и Emacs (хотя я всегда забываю, где он разместил его, когда-то был IIRC на rcpp-devel list).

Редактировать 2012-июль-07:

Вот ваш шаг за шагом:

• (Преамбула: я использовал gcc и g++ уже много лет, и даже когда добавляю -g, я не всегда поворачиваю -O2 в -O0. Я действительно не уверен, что вам это нужно, но как вы просите об этом...)

• Установите переменную среды CXXFLAGS в значение -g -O0 -Wall. Существуют многочисленные способы сделать это, некоторые из них зависят от платформы (например, панель управления Windows) и, следовательно, менее универсальны и интересны. Я использую ~/.R/Makevars для Windows и Unix. Вы могли бы использовать это, или вы могли бы переопределить R-системный RHOME/etc/Makeconf в масштабе всей системы, или вы могли бы использовать Makeconf.site или... См. Полный docs --- но, как я уже сказал, ~/.R/Makevars является моим предпочтительным способом, как он НЕ мешает компиляции вне R.

• Теперь выполняется всякая компиляция R через R CMD SHLIB, R CMD COMPILE, R CMD INSTALL,.... Поэтому вам больше не нужно использовать встроенный или локальный пакет. Продолжение с помощью inline...

• В остальном мы в основном следуем "Раздел 4.4.1 Поиск точек входа в динамически загружаемом коде" из "Написание R-расширений":

• Запустите еще один сеанс R с R -d gdb.

• Скомпилируйте свой код. Для

fun <- cxxfunction(signature(), plugin="Rcpp", verbose=TRUE, body='
   int theAnswer = 42;
   return wrap(theAnswer);
')

Я получаю

[...]
Compilation argument:
 /usr/lib/R/bin/R CMD SHLIB file11673f928501.cpp 2> file11673f928501.cpp.err.txt 
 ccache g++-4.6 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/usr/local/lib/R/site- library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O0 -Wall -c file11673f928501.cpp -o file11673f928501.o
g++-4.6 -shared -o file11673f928501.so file11673f928501.o -L/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/lib -lRcpp -Wl,-rpath,/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/lib -L/usr/lib/R/lib -lR

• Вызовите, например, tempdir(), чтобы увидеть временный каталог, cd, в этот временный каталог, использованный выше, и dyn.load() файл, построенный выше:

 dyn.load("file11673f928501.so")

• Теперь приостановите R, отправив сигнал разрыва (в Emacs, простой выбор из раскрывающегося списка).

• В gdb установите точку останова. Одно назначение выше стало для меня линией 32, поэтому

break file11673f928501.cpp 32
cont

• Вернитесь в R, вызовите функцию:

  весело()

• Presto, в отладчике в точке разрыва мы хотели:

R> fun()

Breakpoint 1, file11673f928501 () at file11673f928501.cpp:32
32      int theAnswer = 42;
(gdb) 

• Теперь вам просто нужно "работать" с gdb для его волшебства.

Теперь, как я сказал в первой попытке, все это было бы проще (на моих глазах) через простой пакет, который Rcpp.package.skeleton() может написать для вас, так как вам не нужно иметь дело со случайными каталогами и именами файлов. Но каждый к своим...