У меня есть некоторые данные в списке, которые мне нужны, чтобы искать непрерывные прогоны целых чисел (Мой мозг думает rle, но не знает, как его использовать здесь).
Легче смотреть на набор данных и объяснять, что мне нужно.
Здесь вид данных:
$greg
[1] 7 8 9 10 11 20 21 22 23 24 30 31 32 33 49
$researcher
[1] 42 43 44 45 46 47 48
$sally
[1] 25 26 27 28 29 37 38 39 40 41
$sam
[1] 1 2 3 4 5 6 16 17 18 19 34 35 36
$teacher
[1] 12 13 14 15
Желаемый вывод:
$greg
[1] 7:11, 20:24, 30:33, 49
$researcher
[1] 42:48
$sally
[1] 25:29, 37:41
$sam
[1] 1:6, 16:19 34:36
$teacher
[1] 12:15
Использовать базовые пакеты, как я могу заменить непрерывный интервал двоеточием между наивысшим и самым низким и запятыми между не непрерывными частями? Обратите внимание, что данные переходят из списка целых векторов в список векторов символов.
Данные MWE:
z <- structure(list(greg = c(7L, 8L, 9L, 10L, 11L, 20L, 21L, 22L,
23L, 24L, 30L, 31L, 32L, 33L, 49L), researcher = 42:48, sally = c(25L,
26L, 27L, 28L, 29L, 37L, 38L, 39L, 40L, 41L), sam = c(1L, 2L,
3L, 4L, 5L, 6L, 16L, 17L, 18L, 19L, 34L, 35L, 36L), teacher = 12:15), .Names = c("greg",
"researcher", "sally", "sam", "teacher"))
Я думаю, что diff - это решение. Возможно, вам понадобится дополнительная игра, посвященная синглонам, но:
lapply(z, function(x) {
diffs <- c(1, diff(x))
start_indexes <- c(1, which(diffs > 1))
end_indexes <- c(start_indexes - 1, length(x))
coloned <- paste(x[start_indexes], x[end_indexes], sep=":")
paste0(coloned, collapse=", ")
})
$greg
[1] "7:11, 20:24, 30:33, 49:49"
$researcher
[1] "42:48"
$sally
[1] "25:29, 37:41"
$sam
[1] "1:6, 16:19, 34:36"
$teacher
[1] "12:15"
Использование IRanges:
require(IRanges)
lapply(z, function(x) {
t <- as.data.frame(reduce(IRanges(x,x)))[,1:2]
apply(t, 1, function(x) paste(unique(x), collapse=":"))
})
# $greg
# [1] "7:11" "20:24" "30:33" "49"
#
# $researcher
# [1] "42:48"
#
# $sally
# [1] "25:29" "37:41"
#
# $sam
# [1] "1:6" "16:19" "34:36"
#
# $teacher
# [1] "12:15"
Вот попытка с использованием diff и tapply возврата символьного вектора
runs <- lapply(z, function(x) {
z <- which(diff(x)!=1);
results <- x[sort(unique(c(1,length(x), z,z+1)))]
lr <- length(results)
collapse <- rep(seq_len(ceiling(lr/2)),each = 2, length.out = lr)
as.vector(tapply(results, collapse, paste, collapse = ':'))
})
runs
$greg
[1] "7:11" "20:24" "30:33" "49"
$researcher
[1] "42:48"
$sally
[1] "25:29" "37:41"
$sam
[1] "1:6" "16:19" "34:36"
$teacher
[1] "12:15"
У меня есть довольно похожее решение для Мариуса, его работ, а также моих, но механизмы немного разные, поэтому я подумал, что могу также опубликовать его:
findIntRuns <- function(run){
rundiff <- c(1, diff(run))
difflist <- split(run, cumsum(rundiff!=1))
unname(sapply(difflist, function(x){
if(length(x) == 1) as.character(x) else paste0(x[1], ":", x[length(x)])
}))
}
lapply(z, findIntRuns)
Что производит:
$greg
[1] "7:11" "20:24" "30:33" "49"
$researcher
[1] "42:48"
$sally
[1] "25:29" "37:41"
$sam
[1] "1:6" "16:19" "34:36"
$teacher
[1] "12:15"
Еще одно короткое решение с lapply и tapply:
lapply(z, function(x)
unname(tapply(x, c(0, cumsum(diff(x) != 1)), FUN = function(y)
paste(unique(range(y)), collapse = ":")
))
)
Результат:
$greg
[1] "7:11" "20:24" "30:33" "49"
$researcher
[1] "42:48"
$sally
[1] "25:29" "37:41"
$sam
[1] "1:6" "16:19" "34:36"
$teacher
[1] "12:15"
Поздно к стороне, но здесь a deparse на основе однострочного интерфейса:
lapply(z,function(x) paste(sapply(split(x,cumsum(c(1,diff(x)-1))),deparse),collapse=", "))
$greg
[1] "7:11, 20:24, 30:33, 49L"
$researcher
[1] "42:48"
$sally
[1] "25:29, 37:41"
$sam
[1] "1:6, 16:19, 34:36"
$teacher
[1] "12:15"