Ответ 1
Когда вы выполняете pod install или pod update, вы должны использовать файл new <YourProject>.xcworkspace вместо старого <YourProject>.xcodeproj файла.
Это происходит потому, что .xcworkspace содержит ваши .xcodeproj и pods. Если вы просто запустите .xcodeproj, pods будет отсутствовать.