Ответ 1
Удаление всей папки .metadata приведет к удалению всех ваших ссылок на проекты из вашей рабочей области.
Если ваш проект фактически полностью сохранен в рабочей области (то есть его источники хранятся в пути по умолчанию для рабочего пространства), вы также потеряете содержимое своего проекта, что еще хуже, поскольку вы не сможете повторно импортировать их.
Я всегда рекомендую сохранить проект Eclipse и его источники отдельно от рабочей области.
См. "Что такое каталог src, созданный Eclipse?".
Таким образом, настройки, специфичные для ваших проектов, сохраняются в вашем проекте (в каталоге .settings), а не в рабочей области.
Кроме того, вам необходимо переместить определения вашего пускового устройства в свой проект.
В этой конфигурации вы можете удалить рабочее пространство без особого ущерба и просто повторно импортировать проект в новое рабочее пространство.