Ответ 1
Написание комментария @hadley в качестве ответа
df_sqlite %>%
group_by(ID) %>%
mutate(Bfoo = if(A=="foo") B else 0) %>%
summarize(sumB = sum(B),
sumBfoo = sum(Bfoo)) %>%
collect
Я проиллюстрирую свой вопрос на примере.
Пример данных:
df <- data.frame(ID = c(1, 1, 2, 2, 3, 5), A = c("foo", "bar", "foo", "foo", "bar", "bar"), B = c(1, 5, 7, 23, 54, 202))
df
ID A B
1 1 foo 1
2 1 bar 5
3 2 foo 7
4 2 foo 23
5 3 bar 54
6 5 bar 202
Что я хочу сделать, это суммировать по ID сумму B и сумму B, когда A является "foo". Я могу сделать это за пару шагов, например:
require(magrittr)
require(dplyr)
df1 <- df %>%
group_by(ID) %>%
summarize(sumB = sum(B))
df2 <- df %>%
filter(A == "foo") %>%
group_by(ID) %>%
summarize(sumBfoo = sum(B))
left_join(df1, df2)
ID sumB sumBfoo
1 1 6 1
2 2 30 30
3 3 54 NA
4 5 202 NA
Тем не менее, я ищу более элегантный/более быстрый способ, поскольку я имею дело с 10gb + из памяти данных в sqlite.
require(sqldf)
my_db <- src_sqlite("my_db.sqlite3", create = T)
df_sqlite <- copy_to(my_db, df)
Я думал использовать mutate
для определения нового столбца Bfoo
:
df_sqlite %>%
mutate(Bfoo = ifelse(A=="foo", B, 0))
К сожалению, это не работает в конце базы данных.
Error in sqliteExecStatement(conn, statement, ...) :
RS-DBI driver: (error in statement: no such function: IFELSE)
Написание комментария @hadley в качестве ответа
df_sqlite %>%
group_by(ID) %>%
mutate(Bfoo = if(A=="foo") B else 0) %>%
summarize(sumB = sum(B),
sumBfoo = sum(Bfoo)) %>%
collect
Вы можете сделать обе суммы в одном dplyr
:
df1 <- df %>%
group_by(ID) %>%
summarize(sumB = sum(B),
sumBfoo = sum(B[A=="foo"]))
Если вы хотите делать подсчет вместо суммирования, то ответ несколько отличается. Изменение кода мало, особенно в условной подсчетной части.
df1 <- df %>%
group_by(ID) %>%
summarize(countB = n(),
countBfoo = sum(A=="foo"))
df1
Source: local data frame [4 x 3]
ID countB countBfoo
1 1 2 1
2 2 2 2
3 3 1 0
4 5 1 0
Если вы хотите посчитать строки, а не суммировать их, можете передать переменную в функцию:
df1 <- df %>%
group_by(ID) %>%
summarize(RowCountB = n(),
RowCountBfoo = n(A=="foo"))
Я получаю ошибку как с n()
и с nrow()
.