Пакет "RTN" недоступен (для версии R версии 3.0.1)

Я получил это, когда пытаюсь установить пакет из биокондуктора, но похоже, что он работает неправильно. Руководство по этому пакету находится здесь:

http://www.bioconductor.org/packages/devel/bioc/manuals/RTN/man/RTN.pdf

Название пакета - RTN.

    biocLite("RTN")
    BioC_mirror: http://bioconductor.org Using Bioconductor version 2.12 (BiocInstaller
    1.10.4), R version 3.0.1.
    Installing package(s) 'RTN'
    Warning messages:
    1: package ‘RTN’ is not available (for R version 3.0.1) 
    2: installed directory not writable, cannot update
       packages 'class', 'foreign', 'lattice', 'MASS',
       'Matrix', 'mgcv', 'nlme', 'nnet', 'rpart',
       'spatial', 'survival' 
    > library(RTN)
    Error in library(RTN) : there is no package called ‘RTN’

Ответы

Ответ 1

Ваша версия Bioconductor (2.12) слишком устарела для RTN, которая была введена (см. целевая страница RTN) в Bioconductor 2.13. Я думаю, вы можете сказать

 source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
 biocLite("BiocUpgrade")

но (а) это может потребовать обновления вашего R и (b) он, скорее всего, обновит (переустановит) любой существующий Bioconductor и, возможно, некоторые пакеты CRAN, поэтому вы должны быть готовы к нескольким ударам на дороге.