Ответ 1
Из macports список ошибок
"Список портов установлен" не делает того, что вы думаете. "Список портов установлен" получает список имен всех установленных портов, и для каждого из них отображается текущая версия, независимо от того, какая версия установлена.
Чтобы увидеть установленные версии, вы хотите использовать "установленный порт".
Неактивные версии представляют собой более старые порты, которые были заменены новыми более активными.
port list inactive
показывает порты, которые больше не используются и в вашем случае должны показывать один из каждого дубликата (или 2 или триплеты и т.д.)
port uninstall inactive
удалит неактивные порты и оставит вас только одним.