Ответ 1
См. здесь для получения информации о хостинге CLR, который имеет отношение к CLR v2 (.NET 2.0, 3.0 и 3.5). Для получения информации о новом API-интерфейсе CLR Hosting в .NET 4.0 см. Здесь.
В основном, CLR действует как библиотека, которая может быть загружена и "размещена" процессом. Вы можете разработать приложение, которое загружает и размещает CLR, если хотите; что позволит вашему приложению содержать всю виртуальную машину CLR, загружать сборки и запускать управляемый код .NET в нем.
SQL Server 2008, например, может это сделать. Вы можете написать код .NET, который хранится в базе данных SQL Server и запускаться из ядра базы данных SQL Server. Для этого SQL Server поддерживает CLR.
Хост CLR, отличный от оболочки Windows (обычный пользовательский интерфейс), может предоставить конкретный контекст для запуска вашего кода. Это может быть полезно для специализированных приложений или очень конкретных сценариев. MSDN (ссылка выше) содержит некоторые рекомендации по этим вопросам.