Как выровнять обычный ggplot с ограненным в комоде?
Я пытаюсь организовать графики в готовой публикации с помощью пакета cowplot
.
Я просто хочу, чтобы панели были одинакового размера и помечены.
Воспроизводимая экспансия
library(ggplot2)
library(cowplot)
gg1 <- ggplot(mtcars)+
geom_point(aes(x=mpg,y=hp))+
theme_bw()+
theme(aspect.ratio=1)
gg2 <- ggplot(mtcars)+
geom_point(aes(x=mpg,y=hp,fill=cyl))+
facet_wrap(~cyl,ncol=2)+
theme_bw()+
theme(aspect.ratio=1,
legend.position='none')
output <- plot_grid(gg1,gg2, labels = c('A','B'),label_size = 20)
print(output)
Код создает этот график.
![введите описание изображения здесь]()
Как вы можете видеть, ни горизонтальные оси не совпадают, ни верхние края панелей.
Аргумент align
из cowplot
не работает с гранями графиков.
Любые идеи?
Ответы
Ответ 1
Так как это один из самых высоких голосовых вопросов относительно коровьего и сложного выравнивания, я хотел бы указать, что теперь у коровника есть некоторые функции для выравнивания граненых сюжетов. (Я автор пакета.) Однако в этом конкретном случае они не работают!
Например, это работает (используя параметр axis
в plot_grid()
):
gg1 <- ggplot(mtcars) +
geom_point(aes(x=mpg, y=hp)) +
theme_bw()
gg2 <- ggplot(mtcars)+
geom_point(aes(x=mpg, y=hp, fill=cyl)) +
facet_wrap(~cyl, ncol=2) +
theme_bw() +
theme(legend.position='none')
plot_grid(gg1, gg2, labels = c('A','B'), label_size = 20,
align = 'h', axis = 'tb')
![введите описание изображения здесь]()
Мы также можем сделать следующее: для получения другого типа выравнивания (в зависимости от того, хотите ли вы, чтобы фасетная линия была подсчитана как часть графика или нет):
plot_grid(gg1, gg2, labels = c('A', 'B'), label_size = 20,
align = 'h', axis = 'b')
![введите описание изображения здесь]()
Теперь почему я сказал, что это не работает для этого случая? Потому что, если вы посмотрите на исходный код в вопросе, вы увидите, что был параметр theme(aspect.ratio=1)
, который я удалил. cowplot может выравнивать графики до тех пор, пока вы не навязываете конкретное соотношение сторон, потому что метод, который он использует для выравнивания графиков, обычно изменяет соотношение сторон отдельных графиков.
Ответ 2
Здесь взломайте, пока кто-то не придумает более элегантный ответ: вы можете использовать grid.arrange
из пакета gridExtra
, чтобы изменить относительные размеры двух графиков, чтобы оси выстроились в линию. Параметр w
в приведенном ниже коде - это то, что управляет тем, что, давая левому графику немного больше горизонтальной ширины, тем самым делая его относительно большим по сравнению с правым графиком.
library(gridExtra)
w = 0.512
grid.arrange(gg1, gg2, widths=c(w,1-w), ncol=2)
Вы также можете использовать arrangeGrob
и textGrob
, чтобы добавить заголовки "A" и "B" к каждому сюжету.
w = 0.512
grid.arrange(arrangeGrob(textGrob("A", x=0.13, gp=gpar(fontface="bold", cex=1.4)),
gg1, heights=c(0.03,0.97)),
arrangeGrob(textGrob("B", x=0.13, gp=gpar(fontface="bold", cex=1.4)),
gg2, heights=c(0.03,0.97)),
widths=c(w,1-w), ncol=2)
В любом случае вам нужно вручную настроить w
, чтобы выстроить графики (что делает этот метод, скажем так, субоптимальным). Соответствующее значение для w
изменится в зависимости от физического размера графика. w=0.512
, казалось, работал хорошо, когда я сохранил график ниже как png
размером 1000 х 500 пикселей.
![введите описание изображения здесь]()
Лучший ответ, вероятно, будет включать что-то, аналогичное этому SO-ответу, но адаптированный для выстраивания фасетированных и необметенных сюжетов (или, в более общем плане, сюжетов, которые не "есть взаимно однозначное соответствие между их составляющими гномами).
Ответ 3
здесь решение, основанное на эта идея
library(ggplot2)
library(grid)
library(gridExtra)
library(gtable)
gtable_frame <- function(g, width=unit(1,"null"), height=unit(1,"null")){
panels <- g[["layout"]][grepl("panel", g[["layout"]][["name"]]), ]
ll <- unique(panels$l)
tt <- unique(panels$t)
fixed_ar <- g$respect
if(fixed_ar) { # there lies madness, want to align despite aspect ratio constraints
ar <- as.numeric(g$heights[tt[1]]) / as.numeric(g$widths[ll[1]])
height <- width * ar
g$respect <- FALSE
}
core <- g[seq(min(tt), max(tt)), seq(min(ll), max(ll))]
top <- g[seq(1, min(tt)-1), ]
bottom <- g[seq(max(tt)+1, nrow(g)), ]
left <- g[, seq(1, min(ll)-1)]
right <- g[, seq(max(ll)+1, ncol(g))]
fg <- nullGrob()
lg <- if(length(left)) g[seq(min(tt), max(tt)), seq(1, min(ll)-1)] else fg
rg <- if(length(right)) g[seq(min(tt), max(tt)), seq(max(ll)+1,ncol(g))] else fg
grobs = list(fg, g[seq(1, min(tt)-1), seq(min(ll), max(ll))], fg,
lg, g[seq(min(tt), max(tt)), seq(min(ll), max(ll))], rg,
fg, g[seq(max(tt)+1, nrow(g)), seq(min(ll), max(ll))], fg)
widths <- unit.c(sum(left$widths), width, sum(right$widths))
heights <- unit.c(sum(top$heights), height, sum(bottom$heights))
all <- gtable_matrix("all", grobs = matrix(grobs, ncol=3, nrow=3, byrow = TRUE),
widths = widths, heights = heights)
all[["layout"]][5,"name"] <- "panel" # make sure knows where the panel is for nested calls
if(fixed_ar) all$respect <- TRUE
all
}
p1 <- ggplot(mtcars)+
geom_point(aes(x=mpg,y=hp))+
theme_bw()+
theme(aspect.ratio=1)
p2 <- ggplot(mtcars)+
geom_point(aes(x=mpg,y=hp,fill=cyl))+
facet_wrap(~cyl,ncol=2)+
theme_bw()+
theme(aspect.ratio=1,
legend.position='none')
g1 <- ggplotGrob(p1)
g2 <- ggplotGrob(p2)
fg1 <- gtable_frame(g1)
fg2 <- gtable_frame(g2)
grid.newpage()
grid.draw(cbind(fg1, fg2))
![введите описание изображения здесь]()
Обратите внимание, что функция gtable_frame переносит графики на основе их панелей, но за исключением панелей по дизайну (я нахожу ее более приятной).
Ответ 4
Я просто хочу добавить, что @baptiste создал большое экспериментальное пакетное яйцо, которое выполняет то, что он написал в его ответ:
Установите его из github (https://github.com/baptiste/egg)
library("devtools")
install_github("baptiste/egg")
Тогда просто do
library("egg")
ggarrange(gg1, gg2, ncol=2)
Вы можете добавлять метки вручную:
ap <- ggarrange(gg1,gg2, ncol=2)
ggdraw(ap) + draw_plot_label(label=c("a","b"), x=c(0,0.5), y=c(1,1))
(Когда я попытался сначала добавить ярлыки к отдельным сюжетам, графики не получили должным образом.)