Ответ 1

Причина

Изменение версий Python без обновления пакета conda нарушает работу Conda.. Изменение версии Python (2.7.14 → 3.6.8) создало ситуацию, когда новый python имеет новый site-packages, который больше не содержит пакет conda, тогда как если вы обновляете только в пределах 2.7.x, это не будет проблемой.

Conda включает в себя как набор двоичных файлов (например, то, что вы вызываете при вводе conda в оболочке), так и пакет Python с тем же именем. Пакет Python необходим для работы всего Conda, и он загружается всякий раз, когда вы пытаетесь использовать conda.

Проблематично то, что многие пакеты в Anaconda, по-видимому, инициируют изменения версии Python, но не запускают обновление пакета conda. Это похоже на то, что средство разрешения зависимостей пропускает - то есть поведение по умолчанию должно защищать целостность базовой среды, в которой живет conda.

Пытаясь восстановить

Один из возможных путей восстановления - временно использовать автономную сборку conda-exec для восстановления вашей базы env. Вы можете выполнять все следующие действия из любого каталога, поэтому, возможно, используйте временную загрузку или куда угодно, куда бы вы ни поместили загрузки. Пожалуйста, сообщите в комментариях, если это работает или нуждается в корректировке!

1. Загрузите соответствующую Conda для вашей платформы (здесь мы будем использовать conda-latest-linux-64.exe). Не берите в голову .exe это двоичный файл и должен запускаться при вызове в оболочке. Я все равно переименую его в conda-exec:

   wget -O conda-exec https://repo.anaconda.com/pkgs/misc/conda-execs/conda-latest-linux-64.exe
   chmod +x conda-exec
   

2. Временно установите CONDA_ROOT_PREFIX в основу вашей установки. Обычно это папка anaconda3 или miniconda3; в этом случае мы будем использовать путь, заданный OP:

   export CONDA_ROOT_PREFIX=/home/me/anaconda2
   

3. Проверьте, что это работает:

   ./conda-exec info
   

   Ключевым моментом, который нужно проверить, является то, что base environment: правильно определяет, где находится ваш базовый env, и показывает его как (writable). Вы также должны увидеть папку pkgs в своей базе env в package cache:.

Вариант 1. Возвращение к предыдущей редакции

4. Определите ревизию непосредственно перед текущей (мы будем обозначать ее здесь <k-1>) и попытайтесь восстановить ее:

   ./conda-exec list -n base --revisions
   ./conda-exec install -n base --revision <k-1>
   

   Если это работает, вы должны быть сделаны. Запустите новую оболочку и попробуйте снова использовать conda. В противном случае, другой вариант...

Вариант 2. Установите conda для текущего Python

4. (Re-) Установите пакет conda в базу env:

   ./conda-exec install -n base conda
   

   Убедитесь, что предлагаемая сборка Conda соответствует установленной версии Python. Флаг --force-reinstall может быть полезен, если он утверждает, что требование уже выполнено.

Попробуйте новую оболочку и посмотрите, работает ли conda. Вам не нужно держать conda-exec рядом.

Последнее обращение

Если ничего не помогает, вам, возможно, придется переустановить. Другие сообщили об установке в других каталогах и возможности использовать и обращаться к их envs.

Предупреждения

Предотвращение прорыва через лучшую практику

Во-первых, просто общая (самоуверенная) рекомендация: использовать виртуальные envs больше. Это напрямую не решает проблему, но поможет вам иметь рабочий процесс, который значительно менее подвержен таким ловушкам. Во-первых, вы не должны были принимать такое огромное изменение, а не базу. Лично я редко устанавливаю вещи в базе вне инфраструктуры (emacs, связанные с jupyter, conda и т.д.). ¹ Программные пакеты входят в специфичные для проекта или, по крайней мере, в среду разработки.

Например, если бы я делал показанную установку, я бы сделал для нее новый env

conda create -n tf36 anaconda::tensorflow-gpu python=3.6

или любую версию Python, в которой вы действительно хотите работать.

Прямое решение: закрепление

Conda поддерживает закрепление пакетов, и это более прямой способ гарантировать, что вы никогда больше не испортите свою базовую установку, переведя Python 2 на 3. А именно, в папке env conda-meta создайте файл pinned и добавьте строку

python 2.7.*

Обратите внимание, что некоторые пользователи сообщали о похожих проблемах при переходах 3,6 → 3,7, поэтому я считаю, что здесь необходимо добавить дополнительную версию. См. документацию по закреплению.

_{[1] Обратите внимание, что я использую Miniconda, а не установщик Anaconda, поэтому у меня больше контроля над базой с самого начала.}